ലൂയിജി റിക്കിയാർഡി 1 , റോസ മസിയോ 2,*©, ആഞ്ചലോ റാffaele Marcotrigiano 1 , ഗുഗ്ലിയൽമോ റെയ്നാൽഡി 3 , പൗലോ ഐവിയോനോ 4 , വിറ്റോ സോണോ 1 , സ്റ്റെഫാനോ പവൻ 1© ഒപ്പം കോൺസെറ്റ ലോട്ടിയും 2,*
- 1 ഡിപ്പാർട്ട്മെൻ്റ് ഓഫ് സോയിൽ, പ്ലാൻ്റ് ആൻഡ് ഫുഡ് സയൻസസ്, പ്ലാൻ്റ് ജെനറ്റിക്സ് ആൻഡ് ബ്രീഡിംഗ് യൂണിറ്റ് യൂണിവേഴ്സിറ്റി ഓഫ് ബാരി, അമെൻഡോള 165/A വഴി, 70125 ബാരി, ഇറ്റലി; luigi.ricciardi@uniba.it (എൽആർ);angelo.marcotrigiano@uniba.it (കൈക്ക്); vito.zonno@uniba.it (VZ); stefano.pavan@uniba.it (എസ്പി)
- 2 ഡിപ്പാർട്ട്മെൻ്റ് ഓഫ് സയൻസസ് ഓഫ് അഗ്രികൾച്ചർ, ഫുഡ് ആൻഡ് എൻവയോൺമെൻ്റ്, യൂണിവേഴ്സിറ്റി ഓഫ് ഫോഗ്ഗിയ, നാപോളി വഴി 25, 71122 ഫോഗ്ഗിയ, ഇറ്റലി
- 3 ഡിപ്പാർട്ട്മെൻ്റ് ഓഫ് ബയോസയൻസസ്, ബയോടെക്നോളജീസ് ആൻഡ് ബയോഫാർമസ്യൂട്ടിക്കൽസ്, യൂണിവേഴ്സിറ്റി ഓഫ് ബാരി, ഒറബോണ വഴി 4, 70125 ബാരി, ഇറ്റലി; guglielmo.rainaldi@uniba.it
- 4 ഡിപ്പാർട്ട്മെൻ്റ് ഓഫ് എനർജി ടെക്നോളജീസ്, ബയോഎനർജി, ബയോഫൈനറി ആൻഡ് ഗ്രീൻ കെമിസ്ട്രി ഡിവിഷൻ, ENEA ട്രൈസിയ റിസർച്ച് സെൻ്റർ, SS 106 Ionica, km 419+500, 75026 Rotondella (MT), ഇറ്റലി; paolo.iovieno@enea.it
* കറസ്പോണ്ടൻസ്: rosa.mazzeo@unifg.it (ആർഎം); concetta.lotti@unifg.it (CL)
സംഗ്രഹം:
ഉള്ളി (അലിയം സെപ എൽ.) ലോകമെമ്പാടുമുള്ള രണ്ടാമത്തെ ഏറ്റവും പ്രധാനപ്പെട്ട പച്ചക്കറി വിളയാണ്, മാത്രമല്ല അതിൻ്റെ ആരോഗ്യ ഗുണങ്ങൾക്ക് പരക്കെ വിലമതിക്കുകയും ചെയ്യുന്നു. കാര്യമായ സാമ്പത്തിക പ്രാധാന്യവും പ്രവർത്തനക്ഷമമായ ഭക്ഷണമെന്ന നിലയിൽ അതിൻ്റെ മൂല്യവും ഉണ്ടായിരുന്നിട്ടും, ഉള്ളി അതിൻ്റെ ജനിതക വൈവിധ്യവുമായി ബന്ധപ്പെട്ട് മോശമായി അന്വേഷിക്കപ്പെട്ടു. ഇവിടെ, ബാരി പ്രവിശ്യയിലെ (അപുലിയ, ഇറ്റലിയുടെ തെക്കൻ) പ്രവിശ്യയിലെ ഒരു ചെറിയ പട്ടണത്തിലെ കൃഷിയുടെ നൂറ്റാണ്ടുകൾ പഴക്കമുള്ള ഒരു ഭൂപ്രദേശമായ "അക്വാവിവ റെഡ് ഉള്ളി" (ARO) യുടെ ജനിതക വ്യതിയാനം ഞങ്ങൾ സർവേ നടത്തി. 11 ARO പോപ്പുലേഷനുകളും മൂന്ന് സാധാരണ വാണിജ്യ തരങ്ങളും അടങ്ങുന്ന ഒരു ജെർംപ്ലാസ് ശേഖരത്തിലെ ജനിതക വ്യതിയാനം പര്യവേക്ഷണം ചെയ്യാൻ 13 മൈക്രോസാറ്റലൈറ്റ് മാർക്കറുകൾ ഉപയോഗിച്ചു. പാരാമെട്രിക്, നോൺ-പാരാമെട്രിക് രീതികളുള്ള ജനിതക ഘടനയുടെ വിശകലനങ്ങൾ, ARO നന്നായി നിർവചിക്കപ്പെട്ട ജീൻ പൂളിനെ പ്രതിനിധീകരിക്കുന്നു, ഇത് പലപ്പോഴും തെറ്റിദ്ധരിക്കപ്പെടുന്ന ട്രോപിയ, മോണ്ടോറോ ലാൻഡ്റേസുകളിൽ നിന്ന് വ്യക്തമായി വ്യത്യസ്തമാണ്. സാധാരണയായി പുതിയ ഉപഭോഗത്തിന് ഉപയോഗിക്കുന്ന ബൾബുകളുടെ ഒരു വിവരണം നൽകുന്നതിനായി, മുകളിൽ സൂചിപ്പിച്ച രണ്ട് ലാൻഡ്റേസുകളുമായി ബന്ധപ്പെട്ട് ARO-യിൽ ഉയർന്ന മാധുര്യം കാണിക്കുന്ന, ലയിക്കുന്ന ഖര ഉള്ളടക്കവും തീവ്രതയും വിലയിരുത്തി. മൊത്തത്തിൽ, നിലവിലെ പഠനം ARO യുടെ ഭാവി മൂല്യനിർണ്ണയത്തിന് ഉപയോഗപ്രദമാണ്, ഇത് വാണിജ്യ വഞ്ചനകൾ പരിമിതപ്പെടുത്തുന്നതിനും ചെറുകിട ഉടമകളുടെ വരുമാനം മെച്ചപ്പെടുത്തുന്നതിനും സഹായിക്കുന്ന ഗുണമേന്മയുള്ള ലേബലുകളിലൂടെ പ്രോത്സാഹിപ്പിക്കാവുന്നതാണ്.
അവതാരിക
അല്ലിയം ജനുസ്സിൽ ഏകദേശം 750 ഇനം [1] ഉൾപ്പെടുന്നു, അവയിൽ ഉള്ളി (Allium cepa L., 2n = 2x =16) ഏറ്റവും വ്യാപകമായ ഒന്നാണ്. എ. സെപയ്ക്ക് ഒരു ദ്വിവത്സര ചക്രവും അതിരുകടന്ന പ്രത്യുൽപാദന സ്വഭാവവുമുണ്ട്. ഇക്കാലത്ത്, ഉള്ളി ആഗോള ഉൽപ്പാദനം (97.9 Mt) തക്കാളി കഴിഞ്ഞാൽ ഏറ്റവും പ്രധാനപ്പെട്ട രണ്ടാമത്തെ പച്ചക്കറി വിളയായി മാറുന്നു [2]. പുരാതന കാലം മുതൽ, ഉള്ളി ബൾബുകൾ ഭക്ഷണമായും നാടോടി ഔഷധ പ്രയോഗങ്ങളിലും ഉപയോഗിക്കുന്നു. തീർച്ചയായും, പുരാതന ഈജിപ്തുകാർ 1550 ബിസിയിലെ ഒരു മെഡിക്കൽ പാപ്പിറസ്, കോഡെക്സ് എബർസ് [3] ൽ വെളുത്തുള്ളി, ഉള്ളി എന്നിവയുടെ ഉപയോഗത്തെ അടിസ്ഥാനമാക്കി നിരവധി ചികിത്സാ സൂത്രവാക്യങ്ങൾ ഇതിനകം റിപ്പോർട്ട് ചെയ്തിട്ടുണ്ട്.
വൈവിധ്യമാർന്നതും ആരോഗ്യകരവുമായ ഈ പച്ചക്കറി അസംസ്കൃതമോ പുതിയതോ സംസ്കരിച്ച ഉൽപ്പന്നമോ ആയി ഉപയോഗിക്കുന്നു, കൂടാതെ പല വിഭവങ്ങളുടെയും രുചി വർദ്ധിപ്പിക്കാൻ ഉപയോഗിക്കുന്നു. ഉള്ളി കഴിക്കുന്നത് ഹൃദയ സംബന്ധമായ അസുഖങ്ങൾ [4,5], പൊണ്ണത്തടി [6], പ്രമേഹം [7], വിവിധ തരത്തിലുള്ള ക്യാൻസർ [8-10] എന്നിവയ്ക്കുള്ള സാധ്യത കുറയ്ക്കുമെന്ന് സമീപകാല പല പഠനങ്ങളും അവകാശപ്പെടുന്നു. ഉള്ളിയുടെ ആരോഗ്യപരമായ അവകാശങ്ങൾ പലപ്പോഴും ഉയർന്ന അളവിലുള്ള രണ്ട് തരം ന്യൂട്രാസ്യൂട്ടിക്കൽ സംയുക്തങ്ങളാണ്: ഫ്ലേവനോയ്ഡുകൾ, ആൽക്ക് (എൻ) യിൽ സിസ്റ്റൈൻ സൾഫോക്സൈഡുകൾ (ACSOs). ഫസ്റ്റ് ക്ലാസിൽ ഫ്ലേവനോളുകളും ആന്തോസയാനിനുകളും ഉൾപ്പെടുന്നു. ഫ്രീ റാഡിക്കൽ സ്കാവെഞ്ചിംഗിലും ട്രാൻസിഷൻ മെറ്റൽ അയോണുകൾ ബൈൻഡിംഗിലും ശക്തമായ ആൻ്റിഓക്സിഡൻ്റിനും ആൻ്റി-ഇൻഫ്ലമേറ്ററി ഗുണങ്ങൾക്കും പേരുകേട്ട പ്രധാന കണ്ടെത്താവുന്ന ഫ്ലേവനോളാണ് ക്വെർസെറ്റിൻ. [11]; അതേസമയം ആന്തോസയാനിൻ ചില ഉള്ളി ഇനങ്ങൾക്ക് ചുവപ്പ്/പർപ്പിൾ നിറം നൽകുന്നു. എസിഎസ്ഒകളെ സംബന്ധിച്ചിടത്തോളം, ഐസോഅല്ലിൻ [(+)-ട്രാൻസ്-എസ്-1-പ്രൊപെനൈൽ-എൽ-സിസ്റ്റൈൻ സൾഫോക്സൈഡ്] ആണ് ഏറ്റവും കൂടുതലുള്ളത്. [12], കോശങ്ങളിൽ സംഭരിച്ചിരിക്കുന്ന അസ്ഥിരമല്ലാത്തതും പ്രോട്ടീനോജെനിക് അല്ലാത്തതുമായ സൾഫർ അമിനോ ആസിഡ് ഉള്ളിയുടെ സുഗന്ധത്തിനും രുചിക്കും പരോക്ഷമായി കാരണമാകുന്നു. [13]. ടിഷ്യു തകരാറിലാകുമ്പോൾ, ഐസോഅല്ലിൻ അലിയ്നേസ് എന്ന എൻസൈം വഴി പിളർന്ന് അസ്ഥിരമായ സംയുക്തങ്ങളുടെ ഒരു പരമ്പര (പൈറുവേറ്റ്, അമോണിയ, തയോസൾഫോണേറ്റുകൾ, പ്രൊപനേതിയൽ എസ്-ഓക്സൈഡ്) ഉത്പാദിപ്പിക്കുന്നു, ഇത് കീറാൻ പ്രേരിപ്പിക്കുകയും അസുഖകരമായ ദുർഗന്ധം ഉണ്ടാക്കുകയും ചെയ്യുന്നു. [14]. ഹൈഡ്രോളിസിസ് വഴി ഉത്പാദിപ്പിക്കുന്ന പൈറൂവിക് ആസിഡിൻ്റെ ഒരു ഗ്രാമിന് പുതിയ ഭാരത്തിൻ്റെ അളവാണ് ഉള്ളി കാഠിന്യം പലപ്പോഴും അളക്കുന്നത്. [15,16].
മെഡിറ്ററേനിയൻ തടത്തിലെ രാജ്യങ്ങളിൽ, ദ്വിതീയ വൈവിധ്യ കേന്ദ്രങ്ങളിൽ ഒന്നായി നിർദ്ദേശിക്കപ്പെടുന്നു എ. സെപ [17,18], ഉള്ളി ബൾബുകൾ ആകൃതി, വലിപ്പം, നിറം, ഉണങ്ങിയ ദ്രവ്യം, തീവ്രത എന്നിവയിൽ വിശാലമായ വ്യതിയാനം കാണിക്കുന്നു [19-22]. കൂടാതെ, സൾഫർ അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള വളപ്രയോഗം, കാർഷിക രീതികൾ, മണ്ണിൻ്റെ തരം, കാലാവസ്ഥാ സാഹചര്യങ്ങൾ, കൃഷിയുടെ അല്ലെങ്കിൽ ലാൻഡ്റേസുകളുടെ ജനിതകരൂപം എന്നിവയ്ക്ക് പ്രത്യേക ഓർഗാനോലെപ്റ്റിക്, പോഷക മൂല്യങ്ങൾ നൽകിക്കൊണ്ട് ബൾബിൻ്റെ ഗുണനിലവാരത്തെ സ്വാധീനിക്കാൻ കഴിയും. [23-27]. ഇറ്റലിയിൽ, ഉള്ളി അണുനാശിനി ലഭ്യത വളരെ കൂടുതലാണെങ്കിലും, ചില ഉള്ളി ഇനങ്ങൾ മാത്രമാണ് പലപ്പോഴും ശാസ്ത്രീയ പഠനങ്ങൾക്ക് വിധേയമാക്കുകയും ശരിയായ സ്വഭാവം കാണിക്കുകയും ചെയ്യുന്നത്. [28,29].
സസ്യ ജനിതക വിഭവങ്ങളുടെ ഉചിതമായ സംരക്ഷണം ഉറപ്പാക്കുന്നതിനും മൂല്യ ശൃംഖലയിൽ നിർദ്ദിഷ്ട ജനിതകരൂപങ്ങളുടെ ഉപയോഗം പ്രോത്സാഹിപ്പിക്കുന്നതിനും കാർഷിക-ജൈവ വൈവിധ്യത്തിൻ്റെ സമഗ്രമായ ജനിതകവും ഫിനോടൈപ്പിക് സ്വഭാവവും നിർണായകമാണ്. [30-32]. മാപ്പിംഗിനായി സിമ്പിൾ സീക്വൻസ് റിപ്പീറ്റ് (എസ്എസ്ആർ) മാർക്കറുകൾ പലപ്പോഴും തിരഞ്ഞെടുത്തിട്ടുണ്ട് [33-35], ഡിഎൻഎ വിരലടയാളവും കൾട്ടിവർ വിവേചനവും [36-38]ലാൻഡ്റേസുകൾക്കകത്തും അവയ്ക്കിടയിലും ജനിതക വ്യതിയാനത്തിൻ്റെ വിശ്വസനീയമായ വിലയിരുത്തലും [39-42], കാരണം അവ ലോക്കസ് സ്പെസിഫിക്, മൾട്ടി-അല്ലെലിക്, കോഡൊമിനൻ്റ് ആയി പാരമ്പര്യമായി ലഭിക്കുന്നത്, ഉയർന്ന പുനരുൽപ്പാദനം, കൂടാതെ ഓട്ടോമേറ്റഡ് ജനിതകരൂപത്തിന് അനുയോജ്യവുമാണ്.
നിലവിലെ പഠനത്തിൽ, ബാരി പ്രവിശ്യയിലെ അക്വാവിവ ഡെല്ലെ ഫോണ്ടി പട്ടണത്തിലെ ഒരു ചെറിയ പ്രദേശത്ത് ജൈവകൃഷി രീതികൾ അനുസരിച്ച് കൃഷി ചെയ്യുന്ന "അക്വാവിവ റെഡ് ഉള്ളി" (ARO) എന്ന അപുലിയൻ പരമ്പരാഗത ലാൻഡ്റേസിലാണ് ഞങ്ങൾ ശ്രദ്ധ കേന്ദ്രീകരിച്ചത്. (അപുലിയ, തെക്കൻ ഇറ്റലി). ഈ ലാൻഡ്റേസിൻ്റെ ബൾബുകൾ വലുതും പരന്നതും ചുവന്ന നിറമുള്ളതുമാണ്, അവ പ്രാദേശിക പാചകക്കുറിപ്പുകളിൽ കൂടുതലായി ഉപയോഗിക്കുന്നു. ARO "സ്ലോ ഫുഡ് പ്രെസിഡിയം" ഗുണനിലവാര അടയാളം നേടിയിട്ടുണ്ടെങ്കിലും, സംരക്ഷിത ഭൂമിശാസ്ത്രപരമായ സൂചന (PGI), സംരക്ഷിത ഉദ്ഭവസ്ഥാനം (POD) പോലുള്ള യൂറോപ്യൻ യൂണിയൻ ഗുണമേന്മയുള്ള അടയാളങ്ങൾ ഉപയോഗിച്ച് അതിൻ്റെ ഉൽപ്പാദനം കൂടുതൽ പ്രോത്സാഹിപ്പിക്കാനും സംരക്ഷിക്കാനും കഴിയും. വാണിജ്യ തട്ടിപ്പുകളും ചെറുകിട ഉടമകളുടെ വരുമാനം മെച്ചപ്പെടുത്തലും. ഇവിടെ, ARO ജനസംഖ്യയിലെ ജനിതക വ്യതിയാനം വിലയിരുത്തുന്നതിനും മറ്റ് രണ്ട് ദക്ഷിണ ഇറ്റാലിയൻ ചുവന്ന ഉള്ളി ലാൻഡ്റേസുകളിൽ നിന്ന് ഈ ലാൻഡ്റേസിനെ വേർതിരിക്കുന്നതിനും SSR മോളിക്യുലാർ മാർക്കറുകൾ ശക്തമായ ഉപകരണങ്ങളായി ഉപയോഗിച്ചു. കൂടാതെ, വിപണി ഡിമാൻഡുമായി ബന്ധപ്പെട്ട് ARO ഫ്ലേവറിനെ വിലയിരുത്തുന്നതിനായി ഞങ്ങൾ തീവ്രതയും ലയിക്കുന്ന സോളിഡ് ഉള്ളടക്കവും കണക്കാക്കി.
ഫലം
അക്വാവിവ റെഡ് ഉള്ളി ജെംപ്ലാസ്ം ശേഖരണവും രൂപാന്തര സ്വഭാവവും സ്ഥാപിക്കൽ
ബയോഡൈവർഎസ്ഒ അപുലിയ റീജിയൻ പ്രോജക്റ്റിൻ്റെ ചട്ടക്കൂടിൽ കർഷകർ സംഭാവന ചെയ്ത ARO ലാൻഡ്റേസിലെ 13 ജനസംഖ്യയുടെ വിത്തുകൾ ഒരു ARO ജെർംപ്ലാസ് ശേഖരണം സ്ഥാപിക്കാൻ ഉപയോഗിച്ചു.
ബൾബ്, തൊലി, മാംസം എന്നിവയുമായി ബന്ധപ്പെട്ട മോർഫോളജിക്കൽ ഡിസ്ക്രിപ്റ്ററുകൾ ARO ജെർംപ്ലാസ്മിലും മൂന്ന് ഉള്ളി ലാൻഡ്റേസുകളിലും ശേഖരിച്ചു, രണ്ടെണ്ണം “ട്രോപിയ റെഡ് ഉള്ളി” (TRO) ലാൻഡ്റേസിനും ഒന്ന് “മോണ്ടോറോ കോപ്പർ ഉള്ളി” (MCO) ലാൻഡ്റേസിനും (ചിത്രം 1). എല്ലാ ARO ബൾബുകളും പരന്നതും ചുവന്ന പുറം തൊലിയും മാംസവും ചുവപ്പിൻ്റെ വ്യത്യസ്ത ഷേഡുകളുള്ളതുമാണ്. ഇതിനു വിപരീതമായി, TRO ബൾബുകളുടെ മാംസം പൂർണ്ണമായും ചുവപ്പായിരുന്നു, അതേസമയം MCO ബൾബുകളുടെ മാംസം മോശമായി പിഗ്മെൻ്റഡ് ആയിരുന്നു (പട്ടിക S1). ബയോകെമിക്കൽ വിശകലനം ഖര ലയിക്കുന്ന ഉള്ളടക്കവും തീവ്രതയും വിലയിരുത്താൻ അനുവദിച്ചു. പട്ടികയിൽ റിപ്പോർട്ട് ചെയ്തതുപോലെ 1, ARO പോപ്പുലേഷനിൽ ബൾബുകളുടെ ഖര ലയിക്കുന്ന ഉള്ളടക്കത്തിൻ്റെ ശരാശരി മൂല്യം 7.60 ആയിരുന്നു, 6.00 (ARO12) മുതൽ 9.50° Brix (ARO11, ARO13) വരെയാണ്. ഈ മൂല്യം TRO, MCO ലാൻഡ്റേസുകൾക്ക് (യഥാക്രമം 4.25, 6.00° Brix) കണക്കാക്കിയതിനേക്കാൾ കൂടുതലാണ്.
പട്ടിക 1. “അക്വാവിവ റെഡ് ഉള്ളി” (ARO), “ട്രോപിയ റെഡ് ഉള്ളി” (TRO), “മോണ്ടോറോ കോപ്പർ ഉള്ളി” (MCO) ജനസംഖ്യയിൽ കണക്കാക്കിയ സോളിഡ് ലയിക്കുന്ന ഉള്ളടക്കവും പഞ്ചൻസി മൂല്യങ്ങളും *.
കോഡ് | ലയിക്കുന്ന സോളിഡ് ഉള്ളടക്കം (ബ്രിക്സ്) | തീവ്രത (pമോൾഗ്-1 FW) | ||
മാധവൻ | CV y (%) | മാധവൻ | CV y (%) | |
ARO1 | 6.25 D * | 5.65 | 5.84 എബി* | 23.78 |
ARO2 | 7.25 DC | 4.87 | ഒരു മണി | 22.98 |
ARO3 | 7.50 ബി.സി.ഡി | 9.42 | 5.28 എബി | 22.88 |
ARO4 | 7.50 ബി.സി.ഡി | 0.00 | ഒരു മണി | 3.74 |
ARO 5 | 7.50 ബി.സി.ഡി | 0.00 | ഒരു മണി | 9.68 |
ARO6 | 6.25 ഡി | 5.65 | 4.51 എബി | 39.18 |
ARO7 | 7.25 DC | 4.87 | 5.25 എബി | 15.44 |
ARO8 | 9.00 AB | 0.00 | ഒരു മണി | 3.49 |
ARO9 | 8.25 എബിസി | 4.28 | ഒരു മണി | 0.15 |
ARO10 | 7.00 DC | 0.00 | 5.94 എബി | 6.57 |
ARO11 | എ | 7.44 | 5.54 എബി | 16.43 |
ARO12 | 6.00 ഡി | 0.00 | 4.91 എബി | 9.70 |
ARO13 | എ | 7.44 | ഒരു മണി | 24.93 |
MCO | 6.00 ഡി | 0.00 | 4.18 എബി | 2.66 |
TRO1 | എൺപത് E | 8.31 | 2.80 ബി | 2.10 |
TRO2 | എൺപത് E | 8.31 | 4.28 എബി | 4.79 |
* വലിയക്ഷരത്തിലോ ചെറിയക്ഷരത്തിലോ ഒരേ അക്ഷരങ്ങളുള്ള അർത്ഥങ്ങൾ യഥാക്രമം 0.01P അല്ലെങ്കിൽ 0.05P-ൽ സ്ഥിതിവിവരക്കണക്കനുസരിച്ച് വ്യത്യസ്തമല്ല (SNK-യുടെ ടെസ്റ്റ്). y ഗുണനഘടകം.
പൈറൂവിക് ആസിഡിൻ്റെ ഉള്ളടക്കം ഉപയോഗിച്ച് വിലയിരുത്തിയ ARO പഞ്ചൻസിയുടെ ശരാശരി മൂല്യം 6.00 ആയിരുന്നു, 4.51 pmol g മുതൽ-1 FW (ARO6) മുതൽ 7.04 (ARO8). ഈ മൂല്യം TRO, MCO ലാൻഡ്റേസുകളിൽ കണക്കാക്കിയതിനേക്കാൾ കൂടുതലാണ് (3.54 pmol g-1 FW ഉം 4.18 pmol ജി-1 FW, യഥാക്രമം).
SSR പോളിമോർഫിസവും പ്രവേശനങ്ങൾക്കിടയിലുള്ള ജനിതക ബന്ധങ്ങളും
നിലവിലെ പഠനത്തിൽ, പരീക്ഷിച്ച 11 എസ്എസ്ആർ പ്രൈമർ കോമ്പിനേഷനുകളിൽ 37 എണ്ണം സിംഗിൾ-ലോക്കസ് പോളിമോർഫിസങ്ങൾ നൽകി, അതായത്, ഒരു വ്യക്തിയിൽ പരമാവധി രണ്ട് ആംപ്ലിഫിക്കേഷൻ ഉൽപ്പന്നങ്ങൾ നൽകുന്നു. മൊത്തത്തിൽ, 55 വ്യക്തികളിൽ 320 (ACM2, ACM 147) മുതൽ 504 (ACM11) വരെയുള്ള അനേകം അല്ലീലുകളും 132 അല്ലീലുകളുടെ ശരാശരി മൂല്യവും ഉള്ള 5 അല്ലീലുകൾ കണ്ടെത്തി (പട്ടിക 2). വ്യക്തിഗത ജനസംഖ്യയിൽ, അല്ലീലുകളുടെ എണ്ണം (Na) 1.94 (ACM147, ACM504) മുതൽ 5.38 (ACM132) വരെയാണ്, അതേസമയം അല്ലീലുകളുടെ (Ne) ഫലപ്രദമായ എണ്ണം 1.41 (ACM152) മുതൽ 2.82 (ACM449) വരെയാണ്. പൊരുത്തക്കേടുകൾ ജനസംഖ്യയിൽ കുറഞ്ഞ ആവൃത്തിയുള്ള അല്ലീലുകളുടെ സാന്നിധ്യവും കുറച്ച് അല്ലീലുകളുടെ മാത്രം ആധിപത്യവും കാരണമാണ് Na, Ne മൂല്യങ്ങൾ തമ്മിലുള്ളത്. ACM138, ACM449 (0.62) എന്നിവയ്ക്കായി ഏറ്റവും ഉയർന്ന നിരീക്ഷിച്ച ഹെറ്ററോസൈഗോസിറ്റി (Ho) മൂല്യം ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്തു, അതേസമയം ഏറ്റവും താഴ്ന്നത് ACM152 (0.25) മായി ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്നു. ഒരു പാൻമിക്റ്റിക് പോപ്പുലേഷനിലെ സൈദ്ധാന്തിക പ്രതീക്ഷയുമായി പൊരുത്തപ്പെടുന്ന, പ്രതീക്ഷിക്കുന്ന ഹെറ്ററോസൈഗോസിറ്റി (He), 0.37 (ACM504) മുതൽ 0.61 (ACM132, ACM138, ACM449) വരെയാണ്. റൈറ്റ്സ് ഫിക്സേഷൻ ഇൻഡക്സ് (Fis), എല്ലാ മാർക്കറുകൾക്കും പൂജ്യത്തിനടുത്തുള്ള മൂല്യങ്ങൾ (ശരാശരി 0.05) പ്രദർശിപ്പിച്ചിരിക്കുന്നു, ഇത് നിരീക്ഷിച്ചതും പ്രതീക്ഷിക്കപ്പെടുന്നതുമായ ഹെറ്ററോസൈഗോസിറ്റി ലെവലുകൾ തമ്മിലുള്ള സമാന മൂല്യങ്ങളെ സൂചിപ്പിക്കുന്നു, ഇത് ഒരു അതിരുകടന്ന സ്പീഷീസിനായി പ്രതീക്ഷിക്കുന്നു. ജനിതക വിരലടയാളത്തിൽ വ്യക്തിഗത എസ്എസ്ആർ മാർക്കറിൻ്റെ കാര്യക്ഷമത പോളിമോർഫിക് ഇൻഫർമേഷൻ ഉള്ളടക്കം (പിഐസി) സൂചിക കണക്കാക്കി, ശരാശരി മൂല്യം 0.48 ആണ്, ഇത് 0.33 (ACM504) മുതൽ 0.67 (ACM132) വരെയാണ്. മറ്റൊരു കാര്യക്ഷമത സൂചിക, ഷാനൻ്റെ ഇൻഫർമേഷൻ ഇൻഡക്സ് (I) ശരാശരി മൂല്യം 0.84 പ്രദർശിപ്പിച്ചു, അനുമാനിച്ച മൂല്യങ്ങൾ 0.45 (ACM152) മുതൽ 1.20 (ACM132) വരെയാണ്.
പട്ടിക 2. ARO, TRO, MCO എന്നിവയിലെ ജനിതക വൈവിധ്യം കണക്കാക്കാൻ ഉപയോഗിക്കുന്ന 11 SSR മാർക്കറുകളുടെ പോളിമോർഫിസം സവിശേഷതകൾ. അല്ലീലുകളുടെ ആകെ എണ്ണം (Na), ബാൻഡ് സൈസ് റേഞ്ച്, പോളിമോർഫിക് ഇൻഫർമേഷൻ ഉള്ളടക്കം (PIC) സൂചിക ഈ പഠനത്തിൽ 320 വ്യക്തികളുടെ ജനിതകരൂപം സൂചിപ്പിക്കുന്നു. അല്ലീലുകളുടെ എണ്ണം (Na), ഫലപ്രദമായ അല്ലീലുകളുടെ എണ്ണം (Ne), നിരീക്ഷിച്ച ഹെറ്ററോസൈഗോസിറ്റി (Ho), പ്രതീക്ഷിക്കുന്ന ഹെറ്ററോസൈഗോസിറ്റി (He), ഫിക്സേഷൻ സൂചിക (Fis), കൂടാതെ ഷാനൻ്റെ വിവര സൂചിക (I) 16 ജനസംഖ്യയിൽ നിന്ന് കണക്കാക്കിയ ശരാശരി മൂല്യങ്ങളെ പരാമർശിക്കുന്നു, ഓരോന്നും 20 വ്യക്തികൾ രചിച്ചതാണ്.
ലോക്കസ്. | ആകെ നാ | വലുപ്പ പരിധി (ബിപി) | pic | മാധവൻ | |||||
Na | Ne | Ho | He | I | Fis | ||||
ACM91 | 4 | 189-205 | 0.40 | 2.63 | 1.72 | 0.38 | 0.39 | 0.66 | 0.04 |
ACM101 | 4 | 229-241 | 0.52 | 2.94 | 2.37 | 0.53 | 0.56 | 0.92 | 0.06 |
ACM132 | 11 | 186-248 | 0.67 | 5.38 | 2.78 | 0.55 | 0.61 | 1.20 | 0.09 |
ACM138 | 5 | 242-272 | 0.66 | 3.69 | 2.82 | 0.62 | 0.61 | 1.09 | -0.02 |
ACM147 | 2 | 264-266 | 0.37 | 1.94 | 1.83 | 0.44 | 0.44 | 0.62 | -0.01 |
ACM152 | 4 | 228-244 | 0.25 | 2.38 | 1.41 | 0.25 | 0.27 | 0.45 | 0.07 |
ACM235 | 4 | 286-298 | 0.41 | 2.81 | 1.77 | 0.44 | 0.41 | 0.72 | -0.06 |
ACM446 | 6 | 108-120 | 0.56 | 3.50 | 2.48 | 0.49 | 0.58 | 1.01 | 0.16 |
ACM449 | 8 | 120-140 | 0.66 | 4.88 | 2.82 | 0.62 | 0.61 | 1.18 | -0.03 |
ACM463 | 5 | 202-210 | 0.47 | 3.38 | 1.95 | 0.46 | 0.48 | 0.83 | 0.05 |
ACM504 | 2 | 188-192 | 0.33 | 1.94 | 1.64 | 0.30 | 0.37 | 0.54 | 0.20 |
മാധവൻ | 5 | 0.48 | 3.22 | 2.15 | 0.46 | 0.48 | 0.84 | 0.05 |
ജനസംഖ്യയിൽ, ARO3, ARO6, ARO8, ARO10, TRO1, MCO എന്നിവ ഉയർന്ന തലത്തിലുള്ള ജനിതക വ്യതിയാനം (Ho > 0.5) പ്രദർശിപ്പിച്ചു, അതേസമയം ARO7 (Ho = 0.27) ജനസംഖ്യയിൽ ഏറ്റവും കുറഞ്ഞ വൈവിധ്യം നിരീക്ഷിക്കപ്പെട്ടു (സപ്ലിമെൻ്ററി പട്ടിക S2). മൊത്തത്തിൽ, എല്ലാ പ്രവേശനങ്ങളും എഫ് പ്രദർശിപ്പിച്ചിരിക്കുന്നുis പൂജ്യത്തിനടുത്തുള്ള മൂല്യങ്ങൾ (എഫ്is ശരാശരി മൂല്യം = 0.054), ക്രമരഹിതമായ ഇണചേരൽ സാഹചര്യങ്ങളിൽ പ്രതീക്ഷിക്കുന്നത് പോലെ.
തന്മാത്രാ വ്യതിയാനത്തിൻ്റെയും ജനിതക ഘടനയുടെയും വിശകലനം
ജനിതക വ്യതിയാനത്തിൻ്റെ ശ്രേണീകൃത വിഭജനം ജനസംഖ്യയ്ക്കിടയിലും അതിനകത്തുമുള്ളത് AMOVA കണക്കാക്കി. ജനസംഖ്യയിലെ ജനിതക വ്യതിയാനത്തിൻ്റെ ഗണ്യമായ ഒരു ഭാഗം ഫലങ്ങൾ ഉയർത്തിക്കാട്ടുന്നു (87%). ജനസംഖ്യയിലെ വ്യത്യാസം, 13%, വളരെ പ്രാധാന്യമുള്ളതാണ് (P < 0.001) (പട്ടിക 3). 0.002 (ARO2/ARO10) മുതൽ 0.468 (ARO7/TRO2) വരെയുള്ള റൈറ്റിൻ്റെ Fst ഫിക്സേഷൻ സൂചികയുടെ സാമ്യമുള്ള Fpt പാരാമീറ്ററിൻ്റെ ജോടിയാക്കൽ മൂല്യങ്ങൾ വളരെ പ്രധാനമാണ് (P <0.05), ഒമ്പത് ജോടിയായി താരതമ്യങ്ങൾ ഒഴികെ (സപ്ലിമെൻ്ററി പട്ടിക S3).
പട്ടിക 3. 320 ജനസംഖ്യയിൽ നിന്നുള്ള 16 ജനിതകരൂപങ്ങളുടെ തന്മാത്രാ വ്യതിയാനത്തിൻ്റെ വിശകലനം അല്ലിയം സെപ L.
ഉറവിടം | df | സ്ക്വയറുകളുടെ ആകെത്തുക | വേരിയൻസ് എസ്റ്റിമേഷൻ | വ്യത്യാസം (%) | Fpt | P |
ജനസംഖ്യയിൽ | 15 | 458.63 | 1.16 | 13% | ||
ജനസംഖ്യയ്ക്കുള്ളിൽ | 304 | 2272.99 | 7.50 | 87% | 0.134 | 0.001 |
ആകെ | 319 | 2731.62 | 8.66 |
ജനിതക ഘടനയെക്കുറിച്ചുള്ള അന്വേഷണം എ. സെപ സോഫ്റ്റ്വെയർ ഘടനയിൽ നടപ്പിലാക്കിയ അഡ്മിക്ചർ മോഡൽ അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള ക്ലസ്റ്ററിംഗ് വിശകലനം വഴിയാണ് ഈ പഠനത്തിൽ ജനിതകരൂപം നൽകിയ ശേഖരം നടത്തിയത്. Evanno AK രീതി രണ്ട് ക്ലസ്റ്ററുകളായി (K = 2) ഉപവിഭജനം നിർദ്ദേശിച്ചു. ഡാറ്റാസെറ്റ്,the തൊട്ടടുത്ത ഏറ്റവും ഉയർന്ന പി.ഇഎകെയിൽ കെ = 5 (സപ്ലിമെൻ്റൈവ് Rgure എസ് 1). ഒരു കെ = 2, ahpopulations wകഴുതigned ഒ വരെnപിന്നെf രണ്ട് ക്ലസ്റ്ററുകൾ കൂടെ ഒരു rnernbertoip ഗുണകം (q) > 0.7. എസ്hoഅകത്ത് ചിത്രം 2a, ആദ്യ ക്ലസ്റ്ററിൽ (S1 എന്ന് നാമകരണം ചെയ്യപ്പെട്ടത്) MCO ഉം എല്ലാ ARO പോപ്പുലേഷനുകളും ഉൾപ്പെടുന്നു, അതേസമയം S2 ക്ലസ്റ്റർ രണ്ട് TRO പോപ്പുലേഷനുകളെ തരംതിരിച്ചു. K = 5-ൽ, ഡാറ്റാസെറ്റിൻ്റെ ആഴത്തിലുള്ള വിവരണം നൽകുന്നു (ചിത്രം 2b), 75% പ്രവേശനങ്ങളും അഞ്ച് ക്ലസ്റ്ററുകളിൽ ഒന്നിലേക്ക് നിയോഗിക്കപ്പെട്ടു. ARO (S1) ഉം TRO (S2) ഉം തമ്മിലുള്ള വേർതിരിവ് സ്ഥിരീകരിച്ചു, എന്നിരുന്നാലും ചില ARO പോപ്പുലേഷനുകൾ ചേർത്തിട്ടുണ്ടെങ്കിലും (q <0.7) അല്ലെങ്കിൽ രണ്ട് പുതിയ ക്ലസ്റ്ററുകളായ S3, S4 (ARO7, ARO12 എന്നിവ യഥാക്രമം) വെവ്വേറെ ഗ്രൂപ്പുചെയ്തു. രസകരമെന്നു പറയട്ടെ, MCO വാണിജ്യ തരം അപുലിയൻ ചുവന്ന ഉള്ളിയിൽ നിന്ന് വേർതിരിച്ച് ഒരു പ്രത്യേക ക്ലസ്റ്റർ (S5) രൂപീകരിച്ചു.
ജനസംഖ്യ തമ്മിലുള്ള ജനിതക ബന്ധങ്ങൾ
ജനിതക വൈവിധ്യത്തിൻ്റെ ഒരു ഡെൻഡ്രോഗ്രാം വരയ്ക്കാൻ എസ്എസ്ആർ പോളിമോർഫിസം അനുവദിച്ചിരിക്കുന്നു, കൂടാതെ ഫൈലോജെനെറ്റിക് വിശകലനത്തിൻ്റെ ഫലങ്ങൾ ചിത്രത്തിൽ കാണിച്ചിരിക്കുന്നു. 3a. ഇവിടെ, ബൂട്ട്സ്ട്രാപ്പ് മൂല്യങ്ങൾ ശക്തമായി പിന്തുണയ്ക്കുന്ന അഞ്ച് ഗ്രൂപ്പുകളായി ജെർംപ്ലാസ് ശേഖരണം വിഭജിക്കപ്പെട്ടു. ARO7, ARO12 പോപ്പുലേഷനുകൾ ബാക്കിയുള്ള ജനസംഖ്യയിൽ നിന്ന് ഉടനടി വേർതിരിച്ച് രണ്ട് വ്യത്യസ്ത ക്ലസ്റ്ററുകൾ രൂപീകരിച്ചു. മൂന്നാമത്തെ ക്ലസ്റ്ററിൽ TRO-യുടെ രണ്ട് വാണിജ്യ പോപ്പുലേഷനുകൾ ഉൾപ്പെടുന്നു, അതേസമയം നാലാമത്തെ നോഡ് MCO-യെ പതിനൊന്ന് ARO പോപ്പുലേഷനുകളിൽ നിന്ന് വിഭജിച്ചു. പ്രിൻസിപ്പൽ കോർഡിനേറ്റ് അനാലിസിസ് (PCoA) (ചിത്രം) വഴി ജനസംഖ്യകൾക്കിടയിൽ സംഭവിക്കുന്ന ജനിതക ബന്ധം കൂടുതൽ അന്വേഷിച്ചു 3b). മുമ്പ് എടുത്തുകാണിച്ചതുപോലെ, പിസിഒഎ പ്ലോട്ടിൽ ഒറ്റപ്പെട്ട സ്ഥാനങ്ങളിൽ പ്രത്യക്ഷപ്പെട്ട ARO12, ARO7 എന്നിവ ഒഴികെ ARO പോപ്പുലേഷനുകൾ കർശനമായി ഗ്രൂപ്പുചെയ്തു. രണ്ട് TRO-കളും MCO പോപ്പുലേഷനുകളും പ്ലോട്ടിൻ്റെ താഴെ-വലത് പാനലിൽ ചിതറിക്കിടക്കുകയായിരുന്നു.
ചിത്രം 3. 16 ഇടയിൽ ജനിതക വൈവിധ്യം എ. സെപ അവരുടെ എസ്എസ്ആർ പ്രൊഫൈലിനെ അടിസ്ഥാനമാക്കി, ഈ പഠനത്തിൽ കാണപ്പെടുന്ന ജനസംഖ്യ. (a) ജനിതക ദൂരത്തിൻ്റെ യുപിജിഎംഎ ഡെൻഡ്രോഗ്രാം. ബൂട്ട്സ്ട്രാപ്പ് പിന്തുണ മൂല്യങ്ങൾ >50 അനുബന്ധ നോഡുകൾക്ക് മുകളിൽ സൂചിപ്പിച്ചിരിക്കുന്നു; (b) പ്രധാന ഘടകം വിശകലനം (PCoA). ചുവപ്പ് നിറത്തിൽ വൃത്താകൃതിയിലുള്ള ക്ലസ്റ്റർ, ഫൈലോജെനെറ്റിക് വിശകലനം വഴി സൃഷ്ടിച്ച ഗ്രൂപ്പുമായി പൂർണ്ണമായും പൊരുത്തപ്പെടുന്നു, കൂടാതെ 11 ARO പ്രവേശനങ്ങളാൽ രൂപീകരിച്ചു.
സംവാദം
തെക്കൻ ഇറ്റലിയിൽ പരമ്പരാഗതമായി കൃഷിചെയ്യുന്ന വലിയ അളവിലുള്ള കാർഷിക-ജൈവവൈവിധ്യത്തിനുള്ളിൽ, ഉള്ളി ലാൻഡ്റേസുകൾ ജനിതക മണ്ണൊലിപ്പിൻ്റെ അപകടസാധ്യതയിൽ നിന്നും ആധുനിക കൃഷിരീതികൾ മാറ്റിസ്ഥാപിക്കുന്നതിനുള്ള ഭീഷണിയിൽ നിന്നും സംരക്ഷിക്കപ്പെടേണ്ട ഉൽപ്പന്നങ്ങളെ പ്രതിനിധീകരിക്കുന്നു. പ്രാദേശിക പൈതൃകവുമായി ശക്തമായി ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്ന അപുലിയ പ്രദേശത്തിൻ്റെ ജനിതക വിഭവങ്ങൾ ശേഖരിക്കാനും, സ്വഭാവം കാണിക്കാനും, പ്രോത്സാഹിപ്പിക്കാനും, സംരക്ഷിക്കാനും ലക്ഷ്യമിട്ടുള്ള റീജിയണൽ പ്രോജക്റ്റ് ബയോഡൈവർഎസ്ഒയുടെ ചട്ടക്കൂടിൽ, ഞങ്ങൾ ARO ലാൻഡ്റേസിലെ 13 ജനസംഖ്യയുടെ ഒരു വിത്ത് ശേഖരണം സ്ഥാപിച്ചു. ഡിഎൻഎ പോളിമോർഫിസങ്ങളുടെയും രണ്ട് ബയോകെമിക്കൽ പാരാമീറ്ററുകളുടെയും അടിസ്ഥാനത്തിലുള്ള ARO വ്യതിയാനത്തിൻ്റെ ആദ്യ വിലയിരുത്തൽ ഞങ്ങൾ റിപ്പോർട്ട് ചെയ്തു, ലയിക്കുന്ന സോളിഡ്, പൈറൂവിക് ആസിഡ് ഉള്ളടക്കങ്ങൾ, രുചി സ്വഭാവങ്ങളുമായി ബന്ധപ്പെട്ടതും പുതിയ പാചകം ചെയ്യാത്ത ഉൽപ്പന്നങ്ങളുടെ സ്വീകാര്യതയ്ക്കുള്ള പ്രാധാന്യവും. കൂടാതെ, ARO ലാൻഡ്റേസിൻ്റെ ഡാറ്റ മറ്റ് രണ്ട് പിഗ്മെൻ്റഡ് ഉള്ളി ലാൻഡ്റേസുകളിൽ നിന്ന് ശേഖരിച്ചവയുമായി താരതമ്യം ചെയ്തു, അത് പലപ്പോഴും തെറ്റിദ്ധരിക്കപ്പെട്ടു.
മധുരമുള്ള ഉള്ളി വ്യവസായ മാർഗ്ഗനിർദ്ദേശങ്ങൾ അനുസരിച്ച്, ഉയർന്ന ലയിക്കുന്ന ഖര ഉള്ളടക്കവും ഇടത്തരം തീവ്രതയുമായി ബന്ധപ്പെട്ട 13 ARO പോപ്പുലേഷനുകളുടെ മാധുര്യത്തെ ബയോകെമിക്കൽ വിശകലനങ്ങൾ എടുത്തുകാണിച്ചു. [31]. ARO ബൾബുകൾ TRO, MCO ലാൻഡ്റേസുകളേക്കാൾ മധുരമുള്ളതും അൽപ്പം ഉയർന്ന തീവ്രതയും പ്രദർശിപ്പിച്ചിരുന്നു. എന്നിരുന്നാലും, ഉള്ളിയിൽ മധുരം ലഭിക്കുന്നത് പഞ്ചസാരയുടെ അംശവും കാഠിന്യവും തമ്മിലുള്ള സന്തുലിതാവസ്ഥ മൂലമാണ്, അതിനാൽ ഈ സ്വഭാവം മൂല്യത്തിൻ്റെ ജനിതകരൂപങ്ങളുടെ തിരഞ്ഞെടുപ്പിനെ പിന്തുണയ്ക്കാൻ ഉപയോഗപ്രദമാകും, ഇത് സാധാരണയായി കർഷകർ രൂപഘടനയെ അടിസ്ഥാനമാക്കി മാത്രം നടത്തുന്നു.
അക്വാവിവ ഡെല്ലെ ഫോണ്ടി പട്ടണം പോലെയുള്ള ഇടുങ്ങിയ വളരുന്ന പ്രദേശത്ത് ശേഖരിക്കപ്പെട്ടിട്ടുണ്ടെങ്കിലും, ജനിതകരൂപങ്ങളെ വിവേചനം ചെയ്യുന്നതിനുള്ള ഉപയോഗപ്രദമായ ഉപകരണമാണ് എസ്എസ്ആർ മാർക്കറുകൾ എന്ന് സ്ഥിരീകരിച്ചു. തിരഞ്ഞെടുത്ത മാർക്കറുകൾ മുമ്പ് റിപ്പോർട്ട് ചെയ്ത മാർക്കറുകളേക്കാൾ ഉയർന്ന അല്ലീലുകൾ പ്രദർശിപ്പിച്ചു [43] ഒപ്പം [44], എന്നാൽ റിപ്പോർട്ട് ചെയ്ത മാർക്കറുകളേക്കാൾ കുറവാണ് [45]. കൂടാതെ, ഞങ്ങളുടെ സെറ്റ് മാർക്കറുകളുടെ 50% 0.5-ൽ കൂടുതൽ PIC സൂചിക മൂല്യങ്ങൾ കാണിച്ചു, ഇത് നിർദ്ദേശിച്ച പ്രകാരം ശേഖരത്തിലെ ജനസംഖ്യയെ വിവേചനം കാണിക്കാൻ അനുയോജ്യമാണെന്ന് തെളിയിക്കുന്നു [46]. ജനസംഖ്യയിലെ വൈവിധ്യത്തിൻ്റെ വിലയിരുത്തൽ ഹോയും ഹിയും തമ്മിലുള്ള സമാന മൂല്യങ്ങൾ വെളിപ്പെടുത്തി, അതിൻ്റെ ഫലമായി കുറഞ്ഞ ഫൈs മൂല്യങ്ങൾ. ഇത് ഔട്ട്-ക്രോസിംഗ് സ്വഭാവവുമായി യോജിക്കുന്നു എ. സെപ, ഇൻ ബ്രീഡിംഗ് വിഷാദം ഗുരുതരമായി അനുഭവിക്കുന്നു [47]. മൊത്തത്തിലുള്ള Fis ഈ പഠനത്തിൽ കണക്കാക്കിയ ഉള്ളി ജനസംഖ്യയിൽ കണക്കാക്കിയ മൂല്യം (0.054) മുമ്പ് റിപ്പോർട്ട് ചെയ്തതിനേക്കാൾ കുറവാണ്. [45] (0.22) കണ്ടെത്തിയതിന് ഏതാണ്ട് സമാനമാണ് [31] (0.08) ഉം [48] (0.00) യഥാക്രമം വടക്കുപടിഞ്ഞാറൻ സ്പെയിനിൽ നിന്നും നൈജറിൽ നിന്നുമുള്ള ഉള്ളി ലാൻഡ്റേസുകളിലെ ജനിതക വൈവിധ്യം വിലയിരുത്തിയവർ. ARO പോപ്പുലേഷനിലെ ശ്രദ്ധേയമായ അളവിലുള്ള ഹെറ്ററോസൈഗോസിറ്റി, അപുലിയ പല ഹോർട്ടികൾച്ചറൽ സ്പീഷീസുകളുടെയും ഒരു വൈവിധ്യ കേന്ദ്രത്തെ പ്രതിനിധീകരിക്കുന്നു എന്ന ധാരണയെ ശക്തിപ്പെടുത്തുന്നു. [32, 42, 49-51].
ഈ പഠനത്തിൽ ജനിതകമാറ്റം വരുത്തിയ ശേഖരത്തിലെ ഏറ്റവും തന്മാത്രാ വ്യതിയാനം ജനസംഖ്യയിൽ ഉണ്ടെന്ന് AMOVA എടുത്തുകാണിച്ചു. എന്നിരുന്നാലും, ജനസംഖ്യയിൽ ഗണ്യമായ ജനിതക വ്യത്യാസം (എഫ്PT മൂല്യങ്ങൾ) ജനിതക വർഗ്ഗീകരണത്തിൻ്റെ സംഭവം വെളിപ്പെടുത്തി. വാസ്തവത്തിൽ, ഞങ്ങളുടെ ഫലങ്ങൾ മിക്ക ARO പോപ്പുലേഷനുകളിലും ജനിതക ഏകീകൃതതയുടെ സാന്നിധ്യം സൂചിപ്പിച്ചെങ്കിലും, നന്നായി നിർവചിക്കപ്പെട്ട ഒരു ക്ലസ്റ്റർ രൂപീകരിക്കുന്നു, ARO7, ARO12 പോപ്പുലേഷനുകൾ വ്യക്തമായ ഒരു ജനിതക പ്രൊഫൈൽ പ്രദർശിപ്പിച്ചു. ജനസംഖ്യ ശേഖരിച്ച രണ്ട് കർഷകർ ഉപയോഗിച്ച വിത്തുകളുടെ വ്യത്യസ്ത ഉത്ഭവം മൂലമാകാം ഈ ഫലം. മാത്രമല്ല, ലഭിച്ച ഫലങ്ങളെ അടിസ്ഥാനമാക്കി, ARO ലാൻഡ്റേസ് ജനിതക തലത്തിൽ TRO, MCO ലാൻഡ്റേസുകളിൽ നിന്ന് വ്യക്തമായി വേറിട്ടുനിൽക്കുന്നതായി കണക്കാക്കാം. അടുത്തിടെ നടത്തിയ ഒരു പഠനത്തിൽ, [29] "അക്വാവിവ," "ട്രോപ്പ", "മോണ്ടോറോ" എന്നിവയുൾപ്പെടെ നിരവധി ഇറ്റാലിയൻ ഉള്ളി ലാൻഡ്റേസുകളുടെ ജനിതക വൈവിധ്യം വിലയിരുത്തി. വിശാലമായ ഉള്ളി ശേഖരത്തിൻ്റെ ജനിതക വൈവിധ്യം വിലയിരുത്താൻ രചയിതാക്കൾ എസ്എൻപി മാർക്കറുകൾ ഉപയോഗിച്ചെങ്കിലും, "ട്രോപിയ", "മോണ്ടോറോ" ഉള്ളികളിൽ നിന്ന് "അക്വാവിവ" എന്നതിനെ വിവേചനം കാണിക്കാൻ ജനിതകരൂപത്തിന് കഴിഞ്ഞില്ല. ഒരുപക്ഷേ, ഈ പൊരുത്തക്കേട് കണ്ടെത്തിയതിൻ്റെ കുറഞ്ഞ ശരാശരി PIC മൂല്യം (0.292) കാരണമായിരിക്കാം, ഇത് ക്ലെയിം ചെയ്തതുപോലെ വിശകലനത്തിന് കീഴിലുള്ള സ്ഥലത്തിൻ്റെ മിതമായ പൊതുവായ വിവരണാത്മകത നിർദ്ദേശിക്കുന്നു. [29]. കൂടാതെ, അവരുടെ ഇറ്റാലിയൻ ക്ലസ്റ്ററിലെ ഉപഘടനയുടെ സാന്നിധ്യം അന്വേഷിക്കുന്നതിന്, ഇറ്റാലിയൻ ജനിതകരൂപങ്ങളെ ബാക്കിയുള്ള ശേഖരത്തിൽ നിന്ന് പ്രത്യേകം വിശകലനം ചെയ്യുന്നത് നന്നായിരിക്കും. ഭൂമിശാസ്ത്രപരമായ സ്ട്രാറ്റിഫിക്കേഷനുമായോ അനുഭവപരമായ തിരഞ്ഞെടുപ്പിന് കീഴിലുള്ള സവിശേഷതകളുമായോ ബന്ധപ്പെട്ടിരിക്കുന്ന ജനിതക വൈവിധ്യത്തിൻ്റെ പാറ്റേൺ ദൃശ്യവൽക്കരിക്കാൻ ഒരുപക്ഷേ ഇത് അനുവദിക്കുമായിരുന്നു.
ഉപസംഹാരമായി, നിലവിലെ പഠനം പ്രാദേശിക സാംസ്കാരിക പൈതൃകവുമായി ബന്ധപ്പെട്ടതും കർഷകർക്ക് സാമ്പത്തിക പ്രാധാന്യമുള്ളതുമായ ഉള്ളി ഭൂപ്രദേശത്തെക്കുറിച്ചുള്ള സമഗ്രമായ റിപ്പോർട്ടിനെ പ്രതിനിധീകരിക്കുന്നു. ചില അപവാദങ്ങളൊഴികെ, ജനിതക മണ്ണൊലിപ്പിൻ്റെ അപകടസാധ്യതയിൽ നിന്ന് സംരക്ഷിക്കപ്പെടാൻ അർഹമായ, നന്നായി നിർവചിക്കപ്പെട്ട ഒരു ജീൻ പൂൾ ARO-യുടെ സവിശേഷതയാണെന്ന് ഞങ്ങളുടെ ഫലങ്ങൾ എടുത്തുകാണിക്കുന്നു. അതിനാൽ, ജനിതക വൈവിധ്യത്തിൻ്റെ ഈ വിലപ്പെട്ട ഉറവിടത്തിൻ്റെ പ്രതിനിധി ശേഖരം സ്ഥാപിക്കുന്നത് നിർണായകമാണ്. അവസാനമായി, യൂറോപ്യൻ യൂണിയനിൽ നിന്ന് ഗുണമേന്മയുള്ള മാർക്ക് ലഭിക്കുന്നതിന് ARO- യുടെ ജനിതകവും ഫിനോടൈപ്പിക് സ്വഭാവവും ഉപയോഗപ്രദമാകും.
വസ്തുക്കളും രീതികളും
ജെർംപ്ലാസം ശേഖരണം, പ്ലാൻ്റ് മെറ്റീരിയൽ, ഡിഎൻഎ എക്സ്ട്രാക്ഷൻ
ARO ലാൻഡ്റേസിൻ്റെ 13 ജനസംഖ്യയുള്ള ഒരു കൂട്ടം അപുലിയ റീജിയൻ പ്രോജക്റ്റിൻ്റെ ചട്ടക്കൂടിനുള്ളിൽ ഏറ്റെടുത്തു (BiodiverSO: https://www.biodiversitapuglia.it/), ഇറ്റലിയിലെ ബാരി പ്രവിശ്യയിലെ ഒരു ചെറിയ അപുലിയൻ പട്ടണമായ "അക്വാവിവ ഡെല്ലെ ഫോണ്ടി"യിൽ നടത്തിയ ദൗത്യങ്ങളുടെ ഒരു പരമ്പരയിലൂടെ. ഓരോ പ്രവേശനത്തിൻ്റെയും ശേഖരണ സൈറ്റുകൾ ജിയോഗ്രാഫിക് ഇൻഫർമേഷൻ സിസ്റ്റം (ജിഐഎസ്) വഴി മാപ്പ് ചെയ്യുകയും പട്ടികയിൽ റിപ്പോർട്ട് ചെയ്യുകയും ചെയ്തു 4. കൂടാതെ, TRO ലാൻഡ്റേസിൽ നിന്നുള്ള രണ്ട് പോപ്പുലേഷനുകളും MCO ലാൻഡ്റേസിൽ നിന്നുള്ള ഒരു ജനസംഖ്യയും നിലവിലെ പഠനത്തിൽ ഉൾപ്പെടുത്തി അവ റഫറൻസുകളായി ഉപയോഗിച്ചു. എല്ലാ സസ്യ വസ്തുക്കളും ഒരേ പാരിസ്ഥിതിക സാഹചര്യത്തിലാണ് ബാരി സർവകലാശാലയുടെ (41° 1'22.08″ N, 16°54'25.95″ E) പരീക്ഷണാത്മക ഫാമിൽ കൃഷി ചെയ്തത്. ഈച്ചകൾ വഴി ജനസംഖ്യയും ഇൻട്രാ പോപ്പുലേഷൻ പരാഗണവും ഉറപ്പാക്കുന്നു (ലൂസിലിയ സീസർ). ബൾബിൻ്റെ വലുപ്പവും ആകൃതിയും ചർമ്മത്തിൻ്റെയും മാംസത്തിൻ്റെയും നിറവും (പട്ടിക S16) എന്നിവയുമായി ബന്ധപ്പെട്ട സ്വഭാവസവിശേഷതകളാണ് 1 ജനസംഖ്യയുടെ സവിശേഷത. കൂടാതെ, ഒരു ഹാൻഡ്-ഹെൽഡ് റിഫ്രാക്റ്റോമീറ്റർ ഉപയോഗിച്ച് സോളിഡ് ലയിക്കുന്ന ഉള്ളടക്ക പരിശോധന നടത്തി, ഉള്ളി ജ്യൂസ് സാമ്പിളുകളിൽ 2,4-ഡിനിട്രോഫെനൈൽ ഹൈഡ്രാസൈൻ (0.125%) ചേർത്ത് തീവ്രത അളക്കുന്നു. v/v HCl-ൻ്റെ 2N-ൽ) റിപ്പോർട്ട് ചെയ്തതുപോലെ, 420 nm-ൽ ആഗിരണം ചെയ്യപ്പെടുന്നു [31]. ഡങ്കൻ്റെ മൾട്ടിപ്പിൾ റേഞ്ച് ടെസ്റ്റും എസ്എൻകെ ടെസ്റ്റും കാര്യമായ വ്യത്യാസങ്ങളുടെ സാന്നിധ്യം നിർണ്ണയിക്കാൻ നടത്തി.
പട്ടിക 4. ഈ പഠനത്തിൽ ശേഖരിക്കപ്പെട്ടതും ജനിതകരൂപത്തിലുള്ളതുമായ ജനസംഖ്യയുടെ പട്ടിക. ഓരോ ജനസംഖ്യയ്ക്കും, ഐഡൻ്റിഫിക്കേഷൻ കോഡ്, പ്രാദേശിക നാമം, ജിപിഎസ് കോർഡിനേറ്റ്, വിത്തുകൾ സംരക്ഷിക്കുന്ന ജീൻ ബാങ്ക് എന്നിവ റിപ്പോർട്ട് ചെയ്യപ്പെടുന്നു.
കോഡ് | പേര് | ജിപിഎസ് കോർഡിനേറ്റുകൾ | ജീൻ ബാങ്ക് y |
ARO1 | സിപോള റോസ ഡി അക്വാവിവ | 40°54’21.708″ N 16°49’1.631” E | ഡി.എസ്.എസ്.പി.എ |
ARO2 | സിപോള റോസ ഡി അക്വാവിവ | 40°53’14.28″ N 16°48’56.879” E | ഡി.എസ്.എസ്.പി.എ |
ARO3 | സിപോള റോസ ഡി അക്വാവിവ | 40°54’11.304″ N 16°49’13.079” E | ഡി.എസ്.എസ്.പി.എ |
ARO4 | സിപോള റോസ ഡി അക്വാവിവ | 40°54’3.348″ N 16°40’27.011” E | ഡി.എസ്.എസ്.പി.എ |
ARO5 | സിപോള റോസ ഡി അക്വാവിവ | 40°51’59.76″ N 16°53’0.527” E | ഡി.എസ്.എസ്.പി.എ |
ARO6 | സിപോള റോസ ഡി അക്വാവിവ | 40°52’48.72″ N 16°49’43.247” E | ഡി.എസ്.എസ്.പി.എ |
ARO7 | സിപോള റോസ ഡി അക്വാവിവ | 40°53’13.47″ N 16°50’23.783” E | ഡി.എസ്.എസ്.പി.എ |
ARO8 | സിപോള റോസ ഡി അക്വാവിവ | 40°53’18.816″ N 16°49’33.888” E | ഡി.എസ്.എസ്.പി.എ |
ARO9 | സിപോള റോസ ഡി അക്വാവിവ | 40°54'51.372″ N 16°49'3.504" E | ഡി.എസ്.എസ്.പി.എ |
ARO10 | സിപോള റോസ ഡി അക്വാവിവ | 40°54’1.188″ N 16°49’24.311” E | ഡി.എസ്.എസ്.പി.എ |
ARO11 | സിപോള റോസ ഡി അക്വാവിവ | 40°52'49.8″ N 16°49'48.575" E | ഡി.എസ്.എസ്.പി.എ |
ARO12 | സിപോള റോസ ഡി അക്വാവിവ | 40°52’38.892″ N 16°49’28.379” E | ഡി.എസ്.എസ്.പി.എ |
ARO13 | സിപോള റോസ ഡി അക്വാവിവ | 40°53’21.768″ N 16°49’29.711” E | ഡി.എസ്.എസ്.പി.എ |
TRO1 | സിപ്പോള റോസ ലുങ്ക ഡി ട്രോപിയ | - | ഡി.എസ്.എസ്.പി.എ |
TRO2 | സിപ്പോള റോസ ടോണ്ട ഡി ട്രോപിയ | - | ഡി.എസ്.എസ്.പി.എ |
MCO | സിപ്പോള റമാറ്റ ഡി മോണ്ടോറോ | - | ഡി.എസ്.എസ്.പി.എ |
y ഡി.എസ്.എസ്.പി.എ., ഡിപ്പാർട്ട്മെൻ്റ് ഓഫ് സോയിൽ, പ്ലാൻ്റ് ആൻഡ് ഫുഡ് സയൻസസ്, ബാരി സർവകലാശാല. |
ഓരോ ജനസംഖ്യയിലും 20 ജനിതകമാതൃകകളുള്ള ഇല വസ്തുക്കൾ സാമ്പിൾ എടുത്ത് -80 ഡിഗ്രി സെൽഷ്യസിൽ സൂക്ഷിച്ചു. പോളിസാക്രറൈഡ് സമ്പന്നമായ ഇനങ്ങൾക്ക്, പോലെ എ. സെപ, നല്ല നിലവാരമുള്ള ഡിഎൻഎ ലഭിക്കുന്നതിന് പോളിസാക്രറൈഡ് നീക്കം ചെയ്യേണ്ട ആദ്യ ഘട്ടങ്ങൾ അത്യന്താപേക്ഷിതമാണ്, അതിനാൽ എസ്ടിഇ ബഫറിൽ (0.25 എം സുക്രോസ്, 0.03 എം ട്രൈസ്, 0.05 എം ഇഡിടിഎ) പ്രാരംഭ വാഷുകൾ നടത്തിയത് വിവരിച്ചതുപോലെയാണ്. [52]. CTAB രീതി പിന്തുടർന്ന് മൊത്തം DNA വേർതിരിച്ചെടുത്തു [53] ഒടുവിൽ നാനോ ഡ്രോപ്പ് 2000 യുവി-വിസ് സ്പെക്ട്രോഫോട്ടോമീറ്റർ (തെർമോ സയൻ്റിഫിക്, വാൽതം, എംഎ, യുഎസ്എ), 0.8% അഗറോസ് ജെൽ ഇലക്ട്രോഫോറെസിസ് എന്നിവ ഉപയോഗിച്ച് ഗുണനിലവാരവും സാന്ദ്രതയും പരിശോധിച്ചു.
എസ്എസ്ആർ വിശകലനം
16 EST-SSR പ്രൈമർ കോമ്പിനേഷനുകൾ വികസിപ്പിച്ചെടുത്തു [54] മുമ്പ് ജനിതക വൈവിധ്യ പഠനങ്ങളിൽ പരീക്ഷിച്ചു [43] ഒപ്പം [44] കൂടാതെ 21 ജീനോമിക് എസ്എസ്ആർ [45-55] അവയുടെ അനുയോജ്യത വിലയിരുത്തുന്നതിനായി സ്ക്രീൻ ചെയ്തു (സപ്ലിമെൻ്ററി പട്ടിക S4). ഓരോ ഫോർവേഡ് എസ്എസ്ആർ പ്രൈമറിലും M13 ടെയിൽ ചേർക്കുന്ന സാമ്പത്തിക ഫ്ലൂറസെൻ്റ് ടാഗിംഗ് രീതി ഉപയോഗിച്ചാണ് ജനിതകമാറ്റം നടത്തിയത്. [56]. PCR മിക്സുകൾ തയ്യാറാക്കിയത് 20 gL റിയാക്ഷനിൽ അടങ്ങിയിരിക്കുന്നു: മൊത്തം DNA യുടെ 50 ng, 0.2 mM dNTP മിക്സ്, 1X PCR റിയാക്ഷൻ ബഫർ, 0.8 U of DreamTaq DNA polymerase (Thermo Scientific, Waltham, MA, USA), 0.16 gM റിവേഴ്സ് പ്രൈമർ , 0.032 gM ഫോർവേഡ് പ്രൈമർ M13 സീക്വൻസ് (5′-TGTAAAACGACGGCCAGT-3′) ഉപയോഗിച്ച് വിപുലീകരിച്ചു, കൂടാതെ FAM അല്ലെങ്കിൽ NED ഫ്ലൂറസെൻ്റ് ഡൈകൾ (സിഗ്മ-ആൽഡ്രിച്ച്, MO) ഉപയോഗിച്ച് ലേബൽ ചെയ്ത യൂണിവേഴ്സൽ M0.08 പ്രൈമറിൻ്റെ 13 gM. ഭൂരിഭാഗം പ്രൈമർ ജോഡികൾക്കും ഇനിപ്പറയുന്ന വ്യവസ്ഥകളോടെ സിംപ്ലിആംപ് (അപ്ലൈഡ് ബയോസിസ്റ്റംസ്, സിഎ, യുഎസ്എ) തെർമോസൈക്ലറിലാണ് PCR പ്രതികരണങ്ങൾ നടത്തിയത്: 94 മിനിറ്റിന് 5 °C, 40 സെക്കൻഡിൽ 94 °C യിൽ 30 സൈക്കിളുകൾ, 58 °C. 45 സെക്കൻഡിനും 72 ഡിഗ്രി സെൽഷ്യസിലും 45 സെക്കൻഡിലും അവസാനത്തെ ദീർഘിപ്പിക്കൽ 72 ഡിഗ്രി സെൽഷ്യസിൽ 5 മിനിറ്റിലും. ACM446, ACM449 എന്നിവയെ സംബന്ധിച്ചിടത്തോളം, 60 സൈക്കിളുകളിൽ 55 °C മുതൽ 10 °C വരെ അനീലിംഗ് ഉപയോഗിച്ച് ഒരു ടച്ച്ഡൗൺ PCR പ്രയോഗിച്ചു, 30 °C-ൽ 55 സൈക്കിളുകൾ, തുടർന്ന് 5 °C-ൽ 72 മിനിറ്റ് അവസാനമായി നീട്ടി. PCR ഉൽപ്പന്നങ്ങൾ 96 കിണർ പ്ലേറ്റിൽ കയറ്റി 14 gL Hi-Di Formamide (ലൈഫ് ടെക്നോളജീസ്, Carlsbad, CA, USA), 0.5 gL GeneScan 500 ROX സൈസ് സ്റ്റാൻഡേർഡ് (ലൈഫ് ടെക്നോളജീസ്, Carlsbad, CA, USA) എന്നിവയുമായി കലർത്തി. ABI PRISM 3100 Avant Genetic Analyzer (Life Technologies, Carlsbad, CA, USA) കാപ്പിലറി സീക്വൻസിങ് മെഷീൻ ഉപയോഗിച്ചാണ് ആംപ്ലിക്കോണുകൾ പരിഹരിച്ചത്, അവിടെ അല്ലീലുകൾ കോ-ഡൊമിനൻ്റായി സ്കോർ ചെയ്യുകയും ജീൻമാപ്പർ സോഫ്റ്റ്വെയർ പതിപ്പ് 3.7 ഉപയോഗിച്ച് അസൈൻ ചെയ്യുകയും ചെയ്തു.
സോഫ്റ്റ്വെയറുകൾ GenAlEx 6.5 [57] കൂടാതെ സെർവസ് 3.0.7 [58] അല്ലീലുകളുടെ എണ്ണം (Na), ഫലപ്രദമായ അല്ലീലുകളുടെ എണ്ണം (Ne), നിരീക്ഷിച്ച ഹെറ്ററോസൈഗോസിറ്റി (Ho), പ്രതീക്ഷിക്കുന്ന ഹെറ്ററോസൈഗോസിറ്റി (He), പോളിമോർഫിക് ഇൻഫർമേഷൻ ഉള്ളടക്കം (PIC), ഷാനൻ്റെ വിവര സൂചിക (I), ഫിക്സേഷൻ ഇൻഡക്സ് (Fis) എന്നിവ കണക്കാക്കാൻ ഉപയോഗിച്ചു. ) ഓരോ SSR ലോക്കസിനും.
ജനിതക വൈവിധ്യത്തിൻ്റെ വിലയിരുത്തൽ
ഉള്ളി ജനസംഖ്യയ്ക്കിടയിലും ഉള്ളിലും ജനിതക വ്യതിയാനത്തിൻ്റെ ശ്രേണിപരമായ വിഭജനം GenAlEx 6.5 വിലയിരുത്തി. [57] 999 ബൂട്ട്സ്ട്രാപ്പിംഗ് ഉപയോഗിച്ച് മോളിക്യുലാർ വേരിയൻസ് (AMOVA) വിശകലനത്തിലൂടെ പ്രാധാന്യം പരിശോധിക്കാൻ. കൂടാതെ, എല്ലാ SSR ലോക്കികളിലും Ho, He, Fis എന്നിവയുടെ ശരാശരി കണക്കാക്കി ഓരോ പോപ്പുലേഷനിലെയും വൈവിധ്യം കണക്കാക്കാൻ GenAlEx 6.5 സോഫ്റ്റ്വെയർ ഉപയോഗിച്ചു.
STRUCTURE v.2.3.4 സോഫ്റ്റ്വെയറിൽ നടപ്പിലാക്കിയ ബയേസിയൻ മോഡൽ അധിഷ്ഠിത ക്ലസ്റ്ററിംഗ് അൽഗോരിതം ഉപയോഗിച്ചാണ് ജനസംഖ്യാ ഘടന അനുമാനിച്ചത്. [59]. 1 മുതൽ 10 വരെയുള്ള നിരവധി സാങ്കൽപ്പിക ക്ലസ്റ്ററുകൾ (കെ) ഉപയോഗിച്ചാണ് ഡാറ്റാ സെറ്റ് പ്രവർത്തിക്കുന്നത്, ഓരോ കെ മൂല്യത്തിനും പത്ത് സ്വതന്ത്ര റണ്ണുകൾ സജ്ജീകരിച്ചു. ഓരോ ഓട്ടത്തിനും, ഫലങ്ങളുടെ സ്ഥിരത പരിശോധിക്കാൻ ലക്ഷ്യമിട്ട്, 100,000 പ്രാരംഭ ബേൺ-ഇൻ കാലയളവും 100,000 മാർക്കോവ് ചെയിൻ മോണ്ടെ കാർലോ (MCMC) ആവർത്തനങ്ങളും അഡ്മിക്ചർ മോഡലിനും ജനസംഖ്യയ്ക്കിടയിലുള്ള സ്വതന്ത്ര അല്ലീൽ ഫ്രീക്വൻസിക്കും കീഴിൽ നടത്തി. ഏറ്റവും സാധ്യതയുള്ള K മൂല്യം നിർണ്ണയിച്ചിരിക്കുന്നത് AK രീതി നടപ്പിലാക്കുന്നതിലൂടെയാണ് [60], വെബ് അധിഷ്ഠിത പ്രോഗ്രാമായ സ്ട്രക്ചർ ഹാർവെസ്റ്ററിൽ [61]. അംഗത്വ ഗുണകം (ക്യു-മൂല്യം) 0.7-നേക്കാൾ കൂടുതലായിരിക്കുമ്പോൾ ഒരു പ്രത്യേക ക്ലസ്റ്ററിലേക്ക് ഒരു വ്യക്തിഗത പോപ്പുലേഷൻ നിയോഗിക്കപ്പെട്ടു, അല്ലാത്തപക്ഷം അത് സമ്മിശ്ര വംശജരായി കണക്കാക്കപ്പെടുന്നു.
Nei യുടെ ജനിതക അകലം മാട്രിക്സ് (സപ്ലിമെൻ്ററി ടേബിൾ S5) വെളിപ്പെടുത്തിയ പ്രവേശനങ്ങൾ തമ്മിലുള്ള ജനിതക ബന്ധത്തിൻ്റെ പാറ്റേണുകൾ ദൃശ്യവൽക്കരിക്കുന്നതിനായി പ്രിൻസിപ്പൽ കോർഡിനേറ്റ് വിശകലനം നടത്തി. അല്ലീൽ ആവൃത്തികളെ അടിസ്ഥാനമാക്കി, POPTREEW സോഫ്റ്റ്വെയറിലെ ഗണിത ശരാശരി (UPGMA) ക്ലസ്റ്റർ വിശകലനം ഉപയോഗിച്ച് വെയ്റ്റഡ് ജോടി ഗ്രൂപ്പ് രീതി നടപ്പിലാക്കുന്ന ജനിതക ദൂരത്തിൻ്റെ ഒരു ഡെൻഡ്രോഗ്രാം നിർമ്മിച്ചു. [62]. ഡാറ്റാ സെറ്റിൻ്റെ 100 റീസാംപ്ലിംഗ് സജ്ജീകരിച്ച് ശ്രേണിപരമായ ക്ലസ്റ്ററിംഗിലെ ആത്മവിശ്വാസം വിലയിരുത്തുന്നതിന് ബൂട്ട്സ്ട്രാപ്പിംഗ് പ്രയോഗിച്ചു. അവസാനമായി, MEGA X സോഫ്റ്റ്വെയർ [63] ട്രീ ഡ്രോയിംഗ് സോഫ്റ്റ്വെയറായി ഉപയോഗിച്ചു.
അനുബന്ധ സാമഗ്രികൾ: ഇനിപ്പറയുന്നവ ഓൺലൈനിൽ ലഭ്യമാണ് http://www.mdpi.com/2223-7747/9/2/260/s1. പട്ടിക S1: ARO, MCO, TRO ബൾബുകളുടെ മോർഫോളജിക്കൽ സ്വഭാവം. പട്ടിക S2: ARO ലാൻഡ്റേസുകൾക്കും TRO, MCO ലാൻഡ്റേസുകൾക്കുമായി കണക്കാക്കിയ ഹെറ്ററോസൈഗോസിറ്റി, ഫിക്സേഷൻ സൂചികകൾ. പട്ടിക S3: Fpt പാരാമീറ്ററിൻ്റെ ജോടിയാക്കൽ മൂല്യങ്ങൾ. പട്ടിക S4: പഠനത്തിൽ ഉപയോഗിച്ച SSR-കളുടെ ലിസ്റ്റ്. പട്ടിക S5. Nei ജനിതക ദൂരത്തിൻ്റെ പെയർവൈസ് പോപ്പുലേഷൻ മാട്രിക്സ്. ചിത്രം S1: ഇവാനോയുടെ ഡെൽറ്റ കെയ്ക്കൊപ്പം മാറുന്ന കെ മൂല്യങ്ങളുടെ ലൈൻ ചാർട്ട്.
സ്രഷ്ടാവ് CL ഉം LR ഉം പഠനം വിഭാവനം ചെയ്യുകയും പരീക്ഷണം രൂപകൽപ്പന ചെയ്യുകയും ചെയ്തു; CL ഉം PI ഉം തന്മാത്രാ മാർക്കർ വിശകലനം നടത്തി; ARM ഉം VZ ഉം ഫീൽഡ് ട്രയലുകൾ നടത്തി; RM, SP, GR, CL എന്നിവ ഡാറ്റ വിശകലനത്തിൽ ഏർപ്പെട്ടിരുന്നു; RM ഉം CL ഉം കൈയെഴുത്തുപ്രതി എഴുതി. എല്ലാ എഴുത്തുകാരും കൈയെഴുത്തുപ്രതിയുടെ പ്രസിദ്ധീകരിച്ച പതിപ്പ് വായിക്കുകയും അംഗീകരിക്കുകയും ചെയ്തിട്ടുണ്ട്.
ഫണ്ടിംഗ്: "അപുലിയൻ പച്ചക്കറി ഇനങ്ങളുടെ ജൈവവൈവിധ്യം"-പ്രോഗ്രാമ ഡി സ്വിലുപ്പോ റൂറൽ പെർ ലാ പുഗ്ലിയ 2014-2020-ൽ നിന്നുള്ള റീജിയണൽ അപുലിയൻ പ്രോജക്റ്റാണ് ഈ ജോലിക്ക് ധനസഹായം നൽകിയത്. മിസുര 10-സോട്ടോമിസുര 10.2; CUP H92C15000270002, ഇറ്റലി.
അറിയിപ്പുകൾ: പരീക്ഷണത്തിൽ ഉപയോഗിച്ച സസ്യ സാമഗ്രികൾ നൽകിയതിന് "Azienda Agricola Iannone Anna", "Associazione produttori della vera cipolla rossa di Acquaviva" എന്നിവയ്ക്കുള്ള അംഗീകാരങ്ങൾ അർഹിക്കുന്നു.
താല്പര്യ സംഘട്ടനങ്ങൾ: എഴുത്തുകാർ പലിശയുടെ തർക്കമൊന്നും പ്രഖ്യാപിക്കുന്നില്ല.
അവലംബം
- 1. Stearn, WT എത്ര ഇനം അല്ലിയം അറിയപ്പെടുന്നു? ക്യൂ മാഗ്. 1992, 9,180-182. [CrossRef]
- 2. FAOSTAT. FAO സ്റ്റാറ്റിസ്റ്റിക്കൽ ഡാറ്റാബേസ്. ഓൺലൈനിൽ ലഭ്യമാണ്: http://www.fao.org/2017 (എക്സസ് ചെയ്തത് 8 ജനുവരി 2019).
- 3. ബ്ലോക്ക്, ഇ. വെളുത്തുള്ളി, ഉള്ളി എന്നിവയുടെ രസതന്ത്രം. സയൻസ്. ആം. 1985, 252,114-119. [CrossRef]
- 4. ലീ, ബി.; ജംഗ്, ജെഎച്ച്; കിം, HS എലിയിലെ ആൻ്റിഓക്സിഡൻ്റ് പ്രവർത്തനത്തെക്കുറിച്ചുള്ള ചുവന്ന ഉള്ളിയുടെ വിലയിരുത്തൽ. ഭക്ഷണം കെം. ടോക്സിക്കോൾ. 2012, 50, 3912-3919. [CrossRef]
- 5. ലീ, എസ്എം; ചന്ദ്രൻ, ജെ.; ചുങ്, JH; ചാ, YJ; ഷിൻ, എംജെ എലികളിലെ ധമനികളിലെ ത്രോംബോസിസിൽ ക്വെർസെറ്റിൻ അടങ്ങിയ ഉള്ളി തൊലിയുടെ സത്തിൽ പ്രഭാവം. ഭക്ഷണം കെം. ടോക്സിക്കോൾ. 2013, 57, 99-105. [CrossRef] [PubMed]
- 6. യോഷിനാരി, ഒ. ഷിയോജിമ, വൈ. ഇഗരാഷി, കെ. സുക്കർ ഡയബറ്റിക് ഫാറ്റി എലികളിൽ ഉള്ളി സത്തിൽ പൊണ്ണത്തടി വിരുദ്ധ ഫലങ്ങൾ. പോഷകങ്ങൾ 2012, 4,1518-1526. [CrossRef]
- 7. ആകാശ്, എംഎസ്എച്ച്; റഹ്മാൻ, കെ. ചെൻ, എസ്. സ്പൈസ് പ്ലാൻ്റ് അല്ലിയം സെപ: ടൈപ്പ് 2 ഡയബറ്റിസ് മെലിറ്റസ് ചികിത്സയ്ക്കുള്ള ഭക്ഷണ സപ്ലിമെൻ്റ്. പോഷകാഹാരം 2014, 30,1128-1137. [CrossRef] [PubMed]
- 8. വാങ്, വൈ.; ടിയാൻ, WX; ഉള്ളിയുടെ Ma, XF ഇൻഹിബിറ്ററി ഇഫക്റ്റുകൾ (അലിയം സെപ എൽ.) ഫാറ്റി ആസിഡ് സിന്തേസ് തടയുന്നതിലൂടെ കാൻസർ കോശങ്ങളുടെയും അഡിപ്പോസൈറ്റുകളുടെയും വ്യാപനത്തെക്കുറിച്ചുള്ള എക്സ്ട്രാക്റ്റ്. ഏഷ്യൻ പാക്. ജെ. കാൻസർ പ്രിവ. 2012,13, 5573-5579. [CrossRef] [PubMed]
- 9. ലായ്, WW; Hsu, SC; ച്യൂ, എഫ്എസ്; ചെൻ, YY; യാങ്, ജെഎസ്; ലിൻ, ജെപി; ലിയാൻ, ജെസി; സായ്, സിഎച്ച്; Chung, JG Quercetin NF-kappaB, matrix metalloproteinase-2/-9 സിഗ്നലിംഗ് പാതകൾ എന്നിവ തടയുന്നതിലൂടെ SAS മനുഷ്യ ഓറൽ കാൻസർ കോശങ്ങളുടെ കുടിയേറ്റത്തെയും അധിനിവേശത്തെയും തടയുന്നു. ആന്റികാൻസർ റെസ്. 2013, 33,1941-1950. [PubMed]
- 10. നികാസ്ട്രോ, എച്ച്എൽ; റോസ്, എസ്എ; മിൽനർ, ജെഎ വെളുത്തുള്ളി, ഉള്ളി: ഇവയുടെ കാൻസർ പ്രതിരോധ ഗുണങ്ങൾ. കാൻസർ മുൻ. Res. 2015, 8,181-189. [CrossRef]
- 11. ഫോർട്ട്, എൽ.; ടോറിസെല്ലി, പി.; ബോണിനി, ഇ.; ഗസ്സാനോ, എം.; റൂബിനി, കെ. ഫിനി, എം.; ബിജി, എ. ക്വെർസെറ്റിൻ-ഫങ്ഷണലൈസ്ഡ് ഹൈഡ്രോക്സിപാറ്റൈറ്റിൻ്റെ ആൻ്റിഓക്സിഡൻ്റും അസ്ഥി നന്നാക്കൽ ഗുണങ്ങളും: ഒരു ഇൻ വിട്രോ ഓസ്റ്റിയോബ്ലാസ്റ്റ്-ഓസ്റ്റിയോക്ലാസ്റ്റ്-എൻഡോതെലിയൽ സെൽ കോ-കൾച്ചർ പഠനം. ആക്റ്റ ബയോമെറ്റർ. 2016, 32, 298-308. [CrossRef]
- 12. യമസാക്കി, വൈ. ഇവാസാക്കി, കെ. മിക്കാമി, എം.; യാഗിഹാഷി, എ. ഏഴ് അല്ലിയം പച്ചക്കറികളിൽ എസ്-ആൽക്ക്(en)yl-L-cysteine ഡെറിവേറ്റീവുകൾ, പതിനൊന്ന് ഫ്ലേവർ മുൻഗാമികളുടെ വിതരണം. ഫുഡ് സയൻസ്. ടെക്നോൾ. Res. 2011, 17, 55-62. [CrossRef]
- 13. ബ്ലോക്ക്, ഇ. അല്ലിയം ജനുസ്സിലെ ഓർഗാനോസൾഫർ രസതന്ത്രം - സൾഫറിൻ്റെ ഓർഗാനിക് കെമിസ്ട്രിയുടെ പ്രത്യാഘാതങ്ങൾ. ആംഗ്യൂ. കെം. Int. എഡ്. ഇംഗ്ലീഷ്. 1992, 31,1135-1178. [CrossRef]
- 14. ഗ്രിഫിത്ത്സ്, ജി. ട്രൂമാൻ, എൽ.; ക്രൗതർ, ടി.; തോമസ്, ബി. സ്മിത്ത്, ബി. ഉള്ളി-ആരോഗ്യത്തിന് ആഗോള നേട്ടം. ഫൈറ്റോതർ. Res. 2002,16, 603-615. [CrossRef]
- 15. ഷ്വിമ്മർ, എസ്.; വെസ്റ്റൺ, ഡബ്ല്യുജെ തീവ്രതയുടെ അളവുകോലായി ഉള്ളിയിലെ പൈറൂവിക് ആസിഡിൻ്റെ എൻസൈമാറ്റിക് വികസനം. ജെ. അഗ്രിക്. ഫുഡ് ചെം. 1961, 9, 301-304. [CrossRef]
- 16. കെറ്റർ, CAT; റാൻഡിൽ, ഉള്ളിയിലെ ഡബ്ല്യുഎം പഞ്ചൻസി വിലയിരുത്തൽ. ഇൻ ലബോറട്ടറി അധ്യാപനത്തിനായി പരീക്ഷിച്ച പഠനങ്ങൾ; കാർച്ചർ, എസ്ജെ, എഡ്. അസോസിയേഷൻ ഫോർ ബയോളജി ലബോറട്ടറി എഡ്യൂക്കേഷൻ (ABLE): ന്യൂയോർക്ക്, NY, USA, 1998; വാല്യം 19, പേജ് 177-196.
- 17. ഹാനെൽറ്റ്, പി ടാക്സോണമി, പരിണാമം, ചരിത്രം. ഇൻ ഉള്ളിയും അനുബന്ധ വിളകളും, വാല്യം. I. സസ്യശാസ്ത്രം, ശരീരശാസ്ത്രം, ജനിതകശാസ്ത്രം; Rabinowitch, HD, Brewster, JL, Eds.; CRC പ്രസ്സ്: ബോക റാറ്റൺ, FL, USA, 1990; പേജ് 1-26.
- 18. റാബിനോവിച്ച്, എച്ച്ഡി; കുറ, എൽ. അല്ലിയം വിള ശാസ്ത്രം: സമീപകാല മുന്നേറ്റങ്ങൾ; CABI പ്രസിദ്ധീകരണം: വാളിംഗ്ഫോർഡ്, യുകെ, 2002.
- 19. മല്ലോർ, സി.; കരാവേഡോ, എം.; എസ്തോപാനൻ, ജി. മല്ലോർ, F. ഉള്ളിയുടെ ജനിതക വിഭവങ്ങളുടെ സ്വഭാവം (അലിയം സെപ L.) സ്പാനിഷ് ദ്വിതീയ വൈവിധ്യ കേന്ദ്രത്തിൽ നിന്ന്. സ്പാൻ. ജെ. അഗ്രിക്. Res. 2011, 9,144-155. [CrossRef]
- 20. ഫെറിയോലി, എഫ്.; D'Antuono, LF പ്രാദേശിക ഉള്ളിയിലെ ഫിനോളിക്സ്, സിസ്റ്റൈൻ സൾഫോക്സൈഡുകൾ എന്നിവയുടെ മൂല്യനിർണ്ണയം, ഇറ്റലി, ഉക്രെയ്ൻ എന്നിവിടങ്ങളിൽ നിന്നുള്ള ഷാലോട്ട് ജെർംപ്ലാസം. ജനെറ്റ്. റിസോർ. ക്രോപ്പ് ഇവോൾ. 2016, 63, 601-614. [CrossRef]
- 21. പെട്രോപൗലോസ്, SA; ഫെർണാണ്ടസ്, എ. ബാരോസ്, എൽ.; ഫെരേര, ഐസിഎഫ്ആർ; Ntatsi, G. ഗ്രീസിൽ നിന്നുള്ള ഉള്ളി ലോക്കൽ ലാൻഡ്രേസായ 'വാറ്റികിയോട്ടിക്കോ' യുടെ രൂപാന്തര, പോഷക, രാസ വിവരണം. ഭക്ഷണം കെം. 2015,182,156-163. [CrossRef]
- 22. ലിഗൂറി, എൽ.; ആദിലറ്റ, ജി. നസാരോ, എഫ്. ഫ്രാറ്റിയാനി, എഫ്. ഡി മാറ്റിയോ, എം.; അൽബനീസ്, ഡി. ബയോകെമിക്കൽ, ആൻ്റിഓക്സിഡൻ്റ് പ്രോപ്പർട്ടികൾ, മെഡിറ്ററേനിയൻ പ്രദേശത്തെ വിവിധ ഉള്ളി ഇനങ്ങളുടെ ആൻ്റിമൈക്രോബയൽ പ്രവർത്തനം. ജെ. ഫുഡ് മീസ്. സ്വഭാവം. 2019,13,1232-1241. [CrossRef]
- 23. യൂ, കെഎസ്; പൈക്ക്, എൽ.; ക്രോസ്ബി, കെ. ജോൺസ്, ആർ.; ലെസ്കോവർ, ഡി. കൃഷികൾ, വളർച്ചാ പരിതസ്ഥിതി, ബൾബുകളുടെ വലുപ്പം എന്നിവ കാരണം ഉള്ളി കാഠിന്യത്തിലെ വ്യത്യാസങ്ങൾ. ശാസ്ത്രം. ഹോർട്ടിക്. 2006,110,144-149. [CrossRef]
- 24. ബീസ്ക്, എൻ.; പെർണർ, എച്ച്.; ഷ്വാർസ്, ഡി.; ജോർജ്ജ്, ഇ. ക്രോഹ്, LW; Rohn, S. ക്വെർസെറ്റിൻ-3, 4′-O-diglucoside, quercetin-4′-O-monoglucoside, quercetin എന്നിവയുടെ വിവിധ ഭാഗങ്ങളിൽ ഉള്ളി ബൾബിൻ്റെ (Allium cepa L.) ജനിതകമാറ്റം സ്വാധീനിക്കുന്നു. ഭക്ഷണം കെം. 2010,122, 566-571. [CrossRef]
- 25. കരുസോ, ജി.; കോണ്ടി, എസ്.; വില്ലാരി, ജി. ബോറെല്ലി, സി.; മെൽചിയോന്ന, ജി. മിനുടോലോ, എം.; റൂസോ, ജി.; അമാൽഫിറ്റാനോ, C. ഉള്ളിയുടെ വിളവ്, ഗുണനിലവാരം, ആൻ്റിഓക്സിഡൻ്റ് ഉള്ളടക്കം എന്നിവയിൽ പറിച്ചുനടുന്ന സമയത്തിൻ്റെയും ചെടികളുടെ സാന്ദ്രതയുടെയും ഫലങ്ങൾ (അലിയം സെപ എൽ.) തെക്കൻ ഇറ്റലിയിൽ. ശാസ്ത്രം. ഹോർട്ടിക്. 2014,166,111-120. [CrossRef]
- 26. പെരെസ്-ഗ്രിഗോറിയോ, എംആർ; റെഗ്യൂറോ, ജെ.; സിമൽ-ഗണ്ഡാര, ജെ.; റോഡ്രിഗസ്, എഎസ്; Almeida, DPF ആൻ്റിഓക്സിഡൻ്റ് ഫ്ലേവനോയ്ഡുകളുടെ ഉറവിടമായി ഉള്ളിയുടെ അധിക മൂല്യം വർദ്ധിപ്പിക്കുന്നു: ഒരു നിർണായക അവലോകനം. ക്രിട്ട്. റവ. ഫുഡ് സയൻസ്. ന്യൂറ്റർ. 2014, 54,1050-1062. [CrossRef] [PubMed]
- 27. പോൺൽ, ടി.; ഷ്വീഗർട്ട്, ആർഎം; Carle, R. ഉള്ളിയിലെ ലയിക്കുന്ന കാർബോഹൈഡ്രേറ്റുകളും തീവ്രമായ തത്ത്വങ്ങളും കൃഷിരീതിയുടെയും കൃഷിരീതിയുടെ തിരഞ്ഞെടുപ്പിൻ്റെയും സ്വാധീനം (അലിയം സെപ എൽ.) ജെ. അഗ്രിക്. ഫുഡ് ചെം. 2018, 66,12827-12835. [CrossRef] [PubMed]
- 28. ടെഡെസ്കോ, ഐ.; കാർബൺ, വി.; സ്പാഗ്നുവോലോ, സി.; മിനാസി, പി.; രണ്ട് തെക്കൻ ഇറ്റാലിയൻ കൃഷിയിനങ്ങളിൽ നിന്നുള്ള ഫ്ലേവനോയിഡുകളുടെ റുസ്സോ, GL തിരിച്ചറിയലും അളവും അല്ലിയം സെപ എൽ., ട്രോപിയ (ചുവന്ന ഉള്ളി), മോണ്ടോറോ (ചെമ്പ് ഉള്ളി), കൂടാതെ മനുഷ്യ എറിത്രോസൈറ്റുകളെ ഓക്സിഡേറ്റീവ് സമ്മർദ്ദത്തിൽ നിന്ന് സംരക്ഷിക്കാനുള്ള അവയുടെ ശേഷി. ജെ. അഗ്രിക്. ഫുഡ് ചെം. 2015, 63, 5229-5238. [CrossRef]
- 29. വില്ലാനോ, സി.; എസ്പോസിറ്റോ, എസ്.; കാരൂച്ചി, എഫ്.; ഫ്രൂസിയാൻറ്, എൽ. കാർപ്യൂട്ടോ, ഡി.; Aversano, R. ഉള്ളിയിലെ ഹൈ-ത്രൂപുട്ട് ജനിതകമാറ്റം ജനിതക വൈവിധ്യത്തിൻ്റെ ഘടനയും തന്മാത്രാ പ്രജനനത്തിന് ഉപയോഗപ്രദമായ വിവരദായകമായ എസ്എൻപികളും വെളിപ്പെടുത്തുന്നു. മോൾ. ഇനം. 2019, 39, 5. [CrossRef]
- 30. മെർകാറ്റി, എഫ്.; ലോംഗോ, സി.; പോമ, ഡി.; അരണിറ്റി, എഫ്.; ലുപിനി, എ.; മമ്മനോ, എംഎം; ഫിയോർ, എംസി; അബേനവോളി, എം.ആർ. സൺസെരി, എഫ് ഒരു ഇറ്റാലിയൻ നീണ്ട ഷെൽഫ് ലൈഫ് തക്കാളിയുടെ ജനിതക വ്യതിയാനം (സോളാനം ലൈക്കോപെർസിക്കം എൽ.) എസ്എസ്ആർ ഉപയോഗിച്ചുള്ള ശേഖരണവും രൂപാന്തര ഫലങ്ങളുടെ സ്വഭാവവും. ജനെറ്റ്. റിസോർ. ക്രോപ്പ് ഇവോൾ. 2014, 62, 721-732. [CrossRef]
- 31. ഗോൺസാലസ്-പെരസ്, എസ്. മല്ലോർ, സി.; ഗാർസെസ്-ക്ലേവർ, എ.; മെറിനോ, എഫ്. തബോദ, എ.; റിവേര, എ.; പോമർ, എഫ്.; പെറോവിക്, ഡി.; സിൽവർ, സി. ഉള്ളിയുടെ ഒരു ശേഖരത്തിൽ ജനിതക വൈവിധ്യവും ഗുണമേന്മയുള്ള സവിശേഷതകളും പര്യവേക്ഷണം ചെയ്യുന്നു (അലിയം സെപ എൽ.) വടക്കുപടിഞ്ഞാറൻ സ്പെയിനിൽ നിന്നുള്ള ലാൻഡ്റേസുകൾ. ജനിതകശാസ്ത്രം 2015, 47, 885-900. [CrossRef]
- 32. ലോട്ടി, സി.; അയോവിനോ, പി.; സെൻ്റോമണി, ഐ.; മാർക്കോട്രിജിയാനോ, AR; ഫാനെല്ലി, വി.; മിമിയോള, ജി. സമ്മോ, സി.; പവൻ, എസ്. Ricciardi, L. കാലെയുടെ ജനിതക, ജൈവ-അഗ്രോമിക്, പോഷകാഹാര സ്വഭാവം (ബ്രാസിക്ക ഒലറേസിയ L. var അസെഫല) ദക്ഷിണ ഇറ്റലിയിലെ അപുലിയയിലെ വൈവിധ്യം. വൈവിധ്യം 2018,10, 25. [CrossRef]
- 33. ബർദാരോ, എൻ. മാർക്കോട്രിജിയാനോ, AR; ബ്രാക്കുട്ടോ, വി.; മസിയോ, ആർ.; റിക്കിയാർഡി, എഫ്.; ലോട്ടി, സി.; പവൻ, എസ്. Ricciardi, L. പ്രതിരോധത്തിൻ്റെ ജനിതക വിശകലനം ഒറോബാഞ്ചെ ക്രെനാറ്റ (ഫോർസ്ക്.) ഒരു കടല (പിസും സാറ്റിവം എൽ.) ലോ-സ്ട്രിഗോലക്റ്റോൺ ലൈൻ. ജെ. പ്ലാൻ്റ് പത്തോൾ. 2016, 98, 671-675.
- 34. വാക്കോ, ടി.; സുകാസാക്കി, എച്ച്.; യഗുച്ചി, എസ്.; യമഷിത, കെ. ഇറ്റോ, എസ്.; ഷിഗ്യോ, എം. ഉള്ളി കുലയ്ക്കുന്നതിനുള്ള ബോൾട്ടിംഗ് സമയത്തിനായുള്ള ക്വാണ്ടിറ്റേറ്റീവ് ട്രെയ്റ്റ് ലോക്കിയുടെ മാപ്പിംഗ് (അലിയം ഫിസ്റ്റുലോസം എൽ.) യൂഫിറ്റിക്ക 2016, 209, 537-546. [CrossRef]
- 35. ധാക്ക, എൻ.; മുഖോപാധ്യായ, എ. പാരിതോഷ്, കെ. ഗുപ്ത, വി.; പെൻ്റൽ, ഡി.; പ്രധാൻ, എകെ ജെനിക് എസ്എസ്ആറുകളുടെ ഐഡൻ്റിഫിക്കേഷനും എസ്എസ്ആർ അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള ലിങ്കേജ് മാപ്പിൻ്റെ നിർമ്മാണവും ബ്രാസിക്ക ജുൻസിയ. യൂഫിറ്റിക്ക 2017, 213, 15. [CrossRef]
- 36. ആനന്ദൻ, എസ്. മോട്ടെ, എസ്ആർ; ഗോപാൽ, ജെ. എസ്എസ്ആർ മാർക്കറുകൾ ഉപയോഗിച്ച് ഉള്ളി വൈവിധ്യമാർന്ന ഐഡൻ്റിറ്റിയുടെ വിലയിരുത്തൽ. വിത്ത് സയൻസ്. ടെക്നോൾ. 2014, 42, 279-285. [CrossRef]
- 37. മിട്രോവ, കെ. സ്വബോദ, പി.; ഒവെസ്ന, ജെ. ചെക്ക് റിപ്പബ്ലിക്കിൽ നിന്നുള്ള ഉള്ളി ഇനങ്ങളെ വ്യത്യസ്തമാക്കുന്നതിനുള്ള ഒരു മാർക്കർ സെറ്റിൻ്റെ തിരഞ്ഞെടുപ്പും സാധൂകരണവും. ചെക്ക് ജെ. ജെനെറ്റ്. പ്ലാൻ്റ് ബ്രീഡ്. 2015, 51, 62-67. [CrossRef]
- 38. ഡി റിയാൻസോ, വി. മിയാസി, എംഎം; ഫാനെല്ലി, വി.; സബെറ്റ, ഡബ്ല്യു.; മോണ്ടെമുറോ, സി. അപുലിയൻ ഒലിവ് ജെർംപ്ലാസം ജൈവവൈവിധ്യത്തിൻ്റെ സംരക്ഷണവും സ്വഭാവവും. ആക്റ്റ ഹോർട്ടിക്. 2018,1199,1-6. [CrossRef]
- 39. മല്ലോർ, സി.; ആർനെഡോ-ആന്ദ്രെസ്, എ.; ഗാർസെസ്-ക്ലേവർ, എ. സ്പാനിഷിൻ്റെ ജനിതക വൈവിധ്യത്തെ വിലയിരുത്തുന്നു അല്ലിയം സെപ മൈക്രോസാറ്റലൈറ്റ് മാർക്കറുകൾ ഉപയോഗിച്ച് ഉള്ളി പ്രജനനത്തിനുള്ള ലാൻഡ്റേസുകൾ. ശാസ്ത്രം. ഹോർട്ടിക്. 2014,170,24-31. [CrossRef]
- 40. റിവേര, എ.; മല്ലോർ, സി.; ഗാർസെസ്-ക്ലേവർ, എ.; ഗാർസിയ-ഉല്ലോവ, എ.; പോമർ, എഫ്.; സിൽവർ, സി. ഉള്ളിയിലെ ജനിതക വൈവിധ്യത്തെ വിലയിരുത്തുന്നു (അല്ലിയം സെപ എൽ.) വടക്കുപടിഞ്ഞാറൻ സ്പെയിനിൽ നിന്നുള്ള ലാൻഡ്റേസുകളും യൂറോപ്യൻ വേരിയബിലിറ്റിയുമായി താരതമ്യപ്പെടുത്തലും. NZJ ക്രോപ്പ് ഹോർട്ടിക്. 2016, 44,103-120. [CrossRef]
- 41. ഡി ജിയോവാനി, സി.; പവൻ, എസ്. ടാരൻ്റോ, എഫ്.; ഡി റിയാൻസോ, വി.; മിയാസി, എംഎം; മാർക്കോട്രിജിയാനോ, AR; മാംഗിനി, ജി. മോണ്ടെമുറോ, സി.; റിക്യാർഡി, എൽ. ലോട്ടി, C. ചിക്ക്പീയുടെ ആഗോള ജെർംപ്ലാസ് ശേഖരത്തിൻ്റെ ജനിതക വ്യതിയാനം (സിസർ അരിറ്റിനം L.) ജനിതക മണ്ണൊലിപ്പിൻ്റെ അപകടസാധ്യതയുള്ള ഇറ്റാലിയൻ പ്രവേശനങ്ങൾ ഉൾപ്പെടെ. ഫിസിയോൾ. മോൾ. ബയോൾ. സസ്യങ്ങൾ 2017, 23,197-205. [CrossRef]
- 42. മസിയോ, ആർ.; മോർഗെസ്, എ.; സൊനാൻ്റെ, ജി.; സുലുഗ, DL; പവൻ, എസ്. റിക്യാർഡി, എൽ. ലോട്ടി, C. ബ്രോക്കോളി റാബിലെ ജനിതക വൈവിധ്യം (ബ്രാസിക്ക റാപ്പ L. subsp. സിൽവെസ്ട്രിസ് (L.) Janch.) തെക്കൻ ഇറ്റലിയിൽ നിന്ന്. ശാസ്ത്രം. ഹോർട്ടിക്. 2019, 253,140-146. [CrossRef]
- 43. ജാക്സെ, എം.; മാർട്ടിൻ, ഡബ്ല്യു.; മക്കല്ലം, ജെ.; ഹാവി, എം. ഉള്ളി കൃഷി തിരിച്ചറിയുന്നതിനുള്ള സിംഗിൾ ന്യൂക്ലിയോടൈഡ് പോളിമോർഫിസങ്ങൾ, ഇൻഡലുകൾ, സിമ്പിൾ സീക്വൻസ് ആവർത്തനങ്ങൾ. ജാം. Soc. ഹോർട്ടിക്. ശാസ്ത്രം. 2005,130, 912-917. [CrossRef]
- 44. മക്കല്ലം, ജെ.; തോംസൺ, എസ്.; പിതർ-ജോയ്സ്, എം. കെനൽ, എഫ്. ജനിതക വൈവിധ്യ വിശകലനം, എക്സ്പ്രസ് സീക്വൻസ് ടാഗ്-സിംപിൾ സീക്വൻസ് റിപ്പീറ്റ് മാർക്കറുകൾ അടിസ്ഥാനമാക്കി കൃഷി ചെയ്ത ബൾബ് ഉള്ളിയിൽ സിംഗിൾ-ന്യൂക്ലിയോടൈഡ് പോളിമോർഫിസം മാർക്കർ വികസനം. ജാം. Soc. ഹോർട്ടിക്. ശാസ്ത്രം. 2008,133, 810-818. [CrossRef]
- 45. ബാൾഡ്വിൻ, എസ്.; പിതർ-ജോയ്സ്, എം. റൈറ്റ്, കെ.; ചെൻ, എൽ.; മക്കല്ലം, ജെ. ബൾബ് ഉള്ളിയിലും അതിനിടയിലും ജനിതക വൈവിധ്യം കണക്കാക്കുന്നതിനുള്ള ശക്തമായ ജീനോമിക് സിമ്പിൾ സീക്വൻസ് റിപ്പീറ്റ് മാർക്കറുകളുടെ വികസനം (അലിയം സെപ L.) ജനസംഖ്യ. മോൾ. ഇനം. 2012, 30,1401-1411. [CrossRef]
- 46. ഡിവുഡി, ജെഎ; ഹണികട്ട്, ആർഎൽ; വെളുത്ത വാലുള്ള മാനുകളിൽ സ്കോ, LC മൈക്രോസാറ്റലൈറ്റ് മാർക്കറുകൾ. ജെ. ഇവിടെ. 1995, 86, 317-319. [CrossRef] [PubMed]
- 47. ഖൊദാദാദി, എം.; ഹസ്സൻപാന, D. ഇറാനിയൻ ഉള്ളി (അലിയം സെപ L.) ഇൻബ്രീഡിംഗ് ഡിപ്രഷനോടുള്ള cultivars പ്രതികരണങ്ങൾ. ലോക ആപ്പ്. ശാസ്ത്രം. ജെ. 2010,11, 426-428.
- 48. അബ്ദു, ആർ.; ബകാസോ, വൈ.; സാദൗ, എം.; ബൌഡോയിൻ, ജെപി; ഹാർഡി, OJ നൈജർ ഉള്ളിയുടെ ജനിതക വൈവിധ്യം (അലിയം സെപ എൽ.) സിമ്പിൾ സീക്വൻസ് റിപ്പീറ്റ് മാർക്കറുകൾ (എസ്എസ്ആർ) ഉപയോഗിച്ച് വിലയിരുത്തുന്നു. ആക്റ്റ ഹോർട്ടിക്. 2016,1143, 77-90. [CrossRef]
- 49. പവൻ, എസ്. ലോട്ടി, സി.; മാർക്കോട്രിജിയാനോ, AR; മസിയോ, ആർ.; ബർദാരോ, എൻ.; ബ്രാക്കുട്ടോ, വി.; റിക്കിയാർഡി, എഫ്.; ടാരൻ്റോ, എഫ്.; ഡി അഗോസ്റ്റിനോ, എൻ. ഷിയാവുല്ലി, എ.; തുടങ്ങിയവർ. ജീനോം-വൈഡ് മാർക്കർ കണ്ടെത്തലും ജനിതകരൂപീകരണവും വഴി വെളിപ്പെടുത്തിയതുപോലെ, കൃഷി ചെയ്ത ചിക്കപ്പയിലെ ഒരു വ്യത്യസ്ത ജനിതക കൂട്ടം. പ്ലാന്റ് ജീനോം 2017, 2017,10. [CrossRef]
- 50. പവൻ, എസ്.; മാർക്കോട്രിജിയാനോ, AR; സിയാനി, ഇ.; മസിയോ, ആർ.; സോണോ, വി.; റുഗ്ഗേരി, വി. ലോട്ടി, സി.; Ricciardi, L. തണ്ണിമത്തൻ്റെ ജനിതകരൂപം ക്രമപ്പെടുത്തൽ (കുക്കുമിസ് മെലോ എൽ.) വൈവിധ്യത്തിൻ്റെ ദ്വിതീയ കേന്ദ്രത്തിൽ നിന്നുള്ള ജെർംപ്ലാസം ശേഖരണം ജനിതക വ്യതിയാനത്തിൻ്റെ പാറ്റേണുകളും വ്യത്യസ്ത ജീൻ പൂളുകളുടെ ജീനോമിക് സവിശേഷതകളും എടുത്തുകാണിക്കുന്നു. ബിഎംസി ജെനോം. 2017, 18, 59. [CrossRef]
- 51. ഡി റിയാൻസോ, വി. സിയോൺ, എസ്.; ടാരൻ്റോ, എഫ്.; ഡി അഗോസ്റ്റിനോ, എൻ. മോണ്ടെമുറോ, സി.; ഫാനെല്ലി, വി.; സബെറ്റ, ഡബ്ല്യു.; ബൗഷെഫ, എസ്.; തമൻജാരി, എ.; പാസ്ക്വലോൺ, എ.; തുടങ്ങിയവർ. മെഡിറ്ററേനിയൻ തടത്തിനുള്ളിലെ ഒലിവ് ജനസംഖ്യയിൽ ജനിതക പ്രവാഹം. പീർ ജെ. 2018, 6. [CrossRef]
- 52. ഷെപ്പേർഡ്, എൽഡി; McLay, TG പോളിസാക്രറൈഡ് സമ്പുഷ്ടമായ സസ്യകോശങ്ങളിൽ നിന്ന് ഡിഎൻഎ വേർതിരിക്കുന്നതിനുള്ള രണ്ട് മൈക്രോ-സ്കെയിൽ പ്രോട്ടോക്കോളുകൾ. ജെ. പ്ലാൻ്റ് റെസ്. 2011,124, 311-314. [CrossRef]
- 53. ഡോയൽ, ജെജെ; ഡോയൽ, ജെഎൽ ഫ്രഷ് ടിഷ്യുവിൽ നിന്ന് പ്ലാൻ്റ് ഡിഎൻഎയുടെ ഒറ്റപ്പെടുത്തൽ. ഫോക്കസ് 1990,12,13-14.
- 54. കുൽ, ജെസി; ച്യൂങ്, എഫ്.; Qiaoping, Y.; മാർട്ടിൻ, ഡബ്ല്യു.; സെവ്ഡി, വൈ.; മക്കല്ലം, ജെ.; കാറ്റനാച്ച്, എ.; റഥർഫോർഡ്, പി.; സിങ്ക്, കെസി; ജെൻഡറെക്, എം.; തുടങ്ങിയവർ. 11,008 ഉള്ളി എക്സ്പ്രസ് സീക്വൻസ് ടാഗുകളുടെ ഒരു സവിശേഷ സെറ്റ്, മോണോകോട്ട് ഓർഡറുകളായ ശതാവരികളും പോൾസും തമ്മിലുള്ള പ്രകടമായ ക്രമവും ജീനോമിക് വ്യത്യാസങ്ങളും വെളിപ്പെടുത്തുന്നു. പ്ലാന്റ് സെൽ 2004,16, 114-125. [CrossRef]
- 55. കിം, HJ; ലീ, എച്ച്ആർ; ഹ്യൂൻ, JY; ഗാനം, കെ.എച്ച്; കിം, കെഎച്ച്; കിം, ജെഇ; ഹർ, സിജി; SSR ഫൈൻഡർ ഉപയോഗിച്ച് ഉള്ളി ജനിതക ശുദ്ധി പരിശോധനയ്ക്കുള്ള ഹാർൺ, CH മാർക്കർ വികസനം. കൊറിയൻ ജെ. ബ്രീഡ്. ശാസ്ത്രം. 2012, 44, 421-432. [CrossRef]
- 56. Schuelke, M. പിസിആർ ശകലങ്ങളുടെ ഫ്ലൂറസൻ്റ് ലേബലിങ്ങിനുള്ള സാമ്പത്തിക രീതി. നാറ്റ്. ബയോടെക്നോൽ. 2000, 18, 233-234. [CrossRef] [PubMed]
- 57. പീക്കൽ, ആർ.; സ്മൗസ്, PE GenAlEx 6.5: Excel-ലെ ജനിതക വിശകലനം. അധ്യാപനത്തിനും ഗവേഷണത്തിനുമുള്ള ജനസംഖ്യാ ജനിതക സോഫ്റ്റ്വെയർ: ഒരു അപ്ഡേറ്റ്. ബയോഇൻഫൊർമാറ്റിക്സ് 2012, 28, 2537-2539. [CrossRef] [PubMed]
- 58. കലിനോവ്സ്കി, ST; ടാപ്പർ, ML; മാർഷൽ, TC കമ്പ്യൂട്ടർ പ്രോഗ്രാം CERVUS ജനിതകമാറ്റ പിശക് എങ്ങനെ ഉൾക്കൊള്ളുന്നു എന്ന് പുനരവലോകനം ചെയ്യുന്നത് പിതൃത്വ നിയമനത്തിൽ വിജയം വർദ്ധിപ്പിക്കുന്നു. മോൾ. ഇക്കോൾ. 2007,16,1099-1106. [CrossRef]
- 59. പ്രിച്ചാർഡ്, ജെകെ; സ്റ്റീഫൻസ്, എം.; റോസൻബർഗ്, NA; ഡോണലി, പി. അസോസിയേഷൻ ഘടനാപരമായ ജനസംഖ്യയിൽ മാപ്പിംഗ്. ആം. ജെ. ഹം. ജനെറ്റ്. 2000, 67, 170-181. [CrossRef]
- 60. ഇവാനോ, ജി.; റെഗ്നൗട്ട്, എസ്.; ഗൗഡെറ്റ്, ജെ. സോഫ്റ്റ്വെയർ സ്ട്രക്ചർ ഉപയോഗിക്കുന്ന വ്യക്തികളുടെ ക്ലസ്റ്ററുകളുടെ എണ്ണം കണ്ടെത്തൽ: ഒരു സിമുലേഷൻ പഠനം. മോൾ. ഇക്കോൾ. 2005,14, 2611-2620. [CrossRef]
- 61. ഏൾ, ഡി.; VonHoldt, B. സ്ട്രക്ചർ ഹാർവെസ്റ്റർ: സ്ട്രക്ചർ ഔട്ട്പുട്ട് ദൃശ്യവൽക്കരിക്കുന്നതിനും ഇവാനോ രീതി നടപ്പിലാക്കുന്നതിനുമുള്ള ഒരു വെബ്സൈറ്റും പ്രോഗ്രാമും. സംരക്ഷിക്കുക. ജനെറ്റ്. റിസോർ. 2011, 4. [CrossRef]
- 62. ടകെസാക്കി, എൻ.; നെയ്, എം.; തമുറ, കെ. പോപ്ട്രീവ്: അല്ലീൽ ഫ്രീക്വൻസി ഡാറ്റയിൽ നിന്ന് പോപ്പുലേഷൻ ട്രീകൾ നിർമ്മിക്കുന്നതിനും മറ്റ് ചില അളവുകൾ കണക്കാക്കുന്നതിനുമുള്ള പോപ്ട്രീയുടെ വെബ് പതിപ്പ്. മോൾ. ബയോൾ. Evol. 2014, 31, 1622-1624. [CrossRef]
- 63. കുമാർ, എസ്. സ്റ്റെച്ചർ, ജി. ലി, എം.; ക്നാസ്, സി.; തമുറ, കെ. MEGA X. കമ്പ്യൂട്ടിംഗ് പ്ലാറ്റ്ഫോമുകളിലുടനീളമുള്ള മോളിക്യുലർ എവല്യൂഷണറി ജനറ്റിക്സ് അനാലിസിസ്. മോൾ. ബയോൾ. Evol. 2018, 35,1547-1549. [CrossRef]